148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1323 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1323  conserved hypothetical protein, putative formyltransferase  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0072434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2224  putative methionyl-tRNA formyltransferase  47.81 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 		 418 aa  168  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0659  methionyl-tRNA formyltransferase  37.33 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116739  normal  0.867777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02909  probable methionyl-tRNA formyltransferase  34.36 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1534  methionyl-tRNA formyltransferase  32.31 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0208  methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  32.03 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491531  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0093  methionyl-tRNA formyltransferase  23.26 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0133  methionyl-tRNA formyltransferase  22.79 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  27.41 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0105  methionyl-tRNA formyltransferase  22.79 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  26.52 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  25.71 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02899  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  27.46 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0140158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  27.68 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1729  methionyl-tRNA formyltransferase  22.1 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2096  hypothetical protein  27.92 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0619627  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  28.75 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  24.85 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  31.33 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154618 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  22.4 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0383  methionyl-tRNA formyltransferase  25.87 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  25.2 
 
 		 314 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1233  conserved hypothetical protein, putative formyltransferase  24.89 
 
 		 297 aa  52  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  23.27 
 
 		 311 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  24.43 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  26.06 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  27.08 
 
 		 313 aa  50.4  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  24.39 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  23.04 
 
 		 317 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  25.78 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 321 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  20.71 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3097  hypothetical protein  26.53 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  24.46 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07970  methionyl-tRNA formyltransferase  26.44 
 
 		 317 aa  48.9  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.152933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  27.22 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  27.96 
 
 		 307 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2400  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  23.67 
 
 		 660 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3396  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  23.67 
 
 		 660 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  19.9 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  19.9 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1712  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  25.83 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0633  formyl transferase domain protein  21.13 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  19.9 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2550  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  24.23 
 
 		 660 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 		 326 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  19.9 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  19.9 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02181  hypothetical protein  23.67 
 
 		 660 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 		 660 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  23.43 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  19.9 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  27.14 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1394  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  23.67 
 
 		 660 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  21.99 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02140  hypothetical protein  23.67 
 
 		 660 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1117  methionyl-tRNA formyltransferase  23.7 
 
 		 314 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  23.94 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  24.6 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  23.57 
 
 		 315 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1499  formyl transferase domain protein  20.93 
 
 		 456 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290814  hitchhiker  0.000921551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02540  methionyl-tRNA formyltransferase  22.34 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0264406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2409  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  24.23 
 
 		 660 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  23.14 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  19.9 
 
 		 315 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0525  hydrogenase regulation HoxX  24.49 
 
 		 565 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  25.32 
 
 		 320 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  22.81 
 
 		 309 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  31.07 
 
 		 328 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  23.73 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  23.4 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  19.4 
 
 		 315 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  20.54 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  32.04 
 
 		 346 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  29.49 
 
 		 311 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  23.56 
 
 		 314 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  23.91 
 
 		 318 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  22.95 
 
 		 312 aa  45.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0506  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 319 aa  45.1  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  27.15 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  27.47 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  21.79 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  28.05 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>