More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1247 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
418 aa  871    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0659  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 
225 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116739  normal  0.867777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2224  putative methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1323  conserved hypothetical protein, putative formyltransferase  37.84 
 
 
228 aa  168  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0072434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02909  probable methionyl-tRNA formyltransferase  34.39 
 
 
222 aa  149  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00640069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1284  MaoC-like dehydratase  33.54 
 
 
318 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 
145 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4266  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  31.58 
 
 
180 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3028  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  36.65 
 
 
172 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1723  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  28.73 
 
 
186 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.845429  hitchhiker  0.000000591031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
188 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.549285  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13053  flagellin modification protein FlmH  29.34 
 
 
180 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2228  MaoC-like dehydratase  30.67 
 
 
203 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01540  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  37.5 
 
 
173 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0257601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1968  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 
187 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183643  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2892  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.928295  normal  0.0223783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
178 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1196  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195338  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2883  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0551656  normal  0.0742121 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
177 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0208  methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  27.27 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2212  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  30.3 
 
 
162 aa  63.5  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  29.34 
 
 
179 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3074  hypothetical protein  27.12 
 
 
201 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
195 aa  60.1  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3097  hypothetical protein  27.63 
 
 
208 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  26.19 
 
 
314 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
255 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
189 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18350  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  27.07 
 
 
662 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208091  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  21.77 
 
 
311 aa  53.9  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
175 aa  53.5  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2096  hypothetical protein  24.14 
 
 
219 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0619627  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2932  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
182 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0153421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  28.07 
 
 
328 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
176 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457106  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2705  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
182 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0239  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 
180 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0840  GCN5-related N-acetyltransferase  22.35 
 
 
183 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000217088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0259  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
143 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7751  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  28.82 
 
 
194 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464217  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4820  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  40.23 
 
 
182 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  33.73 
 
 
308 aa  53.1  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4825  ribosomal-protein-serine acetyltransferase, putative  40.23 
 
 
182 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3621  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
371 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02899  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  27.4 
 
 
172 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0140158  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
181 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3339  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
197 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1195  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
168 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.89265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2827  GCN5-related N-acetyltransferase  24.4 
 
 
182 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  0.971472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2843  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  25.42 
 
 
668 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322328  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4798  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  37.93 
 
 
182 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  23.21 
 
 
170 aa  52.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.263332  hitchhiker  0.00000000268657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5745  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3471  acetyltransferase, gnat family  40.32 
 
 
183 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0658  hypothetical protein  25.69 
 
 
170 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30991  normal  0.843566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
183 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  24.56 
 
 
311 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1778  acetyltransferase  39.06 
 
 
183 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357267  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 
286 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
205 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4559  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3338  acetyltransferase  34.25 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.667425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382869  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  26.61 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1591  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  26.52 
 
 
662 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  27.62 
 
 
318 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3187  acetyltransferase  39.06 
 
 
183 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0440  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  36.78 
 
 
182 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
182 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000648101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  28.42 
 
 
311 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  21.64 
 
 
299 aa  50.4  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3484  acetyltransferase  39.06 
 
 
183 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.596039  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  21.46 
 
 
313 aa  50.4  0.00006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
185 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  26.38 
 
 
311 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3559  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
218 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0467  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
176 aa  50.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
184 aa  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  32.91 
 
 
314 aa  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3725  Methionyl-tRNA formyltransferase  23.56 
 
 
311 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.715086  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
181 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  33.71 
 
 
177 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
307 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0432  putative formyltransferase  23.53 
 
 
289 aa  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  23.85 
 
 
317 aa  50.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
181 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  27.19 
 
 
319 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4372  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
184 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>