More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1284 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1284  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
318 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4266  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  38.79 
 
 
180 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13053  flagellin modification protein FlmH  40.12 
 
 
180 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2892  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.928295  normal  0.0223783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
188 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.549285  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1723  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  33.52 
 
 
186 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.845429  hitchhiker  0.000000591031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1968  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183643  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
145 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
418 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2883  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
184 aa  99.4  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0551656  normal  0.0742121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01540  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.96 
 
 
173 aa  99.4  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0257601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3028  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  32.03 
 
 
172 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
195 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  40.34 
 
 
158 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13048  predicted acyl dehydratase  44.21 
 
 
140 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.620286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1196  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
162 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195338  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  40.52 
 
 
149 aa  89  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3256  MaoC domain protein dehydratase  37.93 
 
 
137 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  35.16 
 
 
134 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  33.82 
 
 
156 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3533  MaoC domain protein dehydratase  34.43 
 
 
138 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2228  MaoC-like dehydratase  31.28 
 
 
203 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4044  MaoC-like dehydratase  35.25 
 
 
155 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738131  normal  0.82003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2482  dehydratase  41.94 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895902  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2202  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36 
 
 
467 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.878399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  34.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  31.67 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
157 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.93 
 
 
147 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  31.3 
 
 
158 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  34.11 
 
 
156 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  41.05 
 
 
473 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3444  dehydratase  33.33 
 
 
157 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.523272  normal  0.0613814 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  41.05 
 
 
473 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  37.07 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  38.02 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  37.38 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  38.79 
 
 
147 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0145  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.89 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.880803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  34.59 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  37.07 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  37.07 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.07 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2798  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.89 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0121  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.89 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2655  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.89 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1058  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.89 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  37.07 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  37.07 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0417  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.38 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1286  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.89 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.93 
 
 
481 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.93 
 
 
481 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  37.07 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  37.07 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  40 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  34.62 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  36.04 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  33.33 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  34.48 
 
 
135 aa  79  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2797  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.34 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.48 
 
 
134 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  30.23 
 
 
144 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  41.11 
 
 
184 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3074  hypothetical protein  25.99 
 
 
201 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
189 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4251  MaoC domain protein dehydratase  36.3 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  39.53 
 
 
147 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.07 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  32.56 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  36.54 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  35.65 
 
 
147 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  32.56 
 
 
156 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  35.65 
 
 
147 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  37.78 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  31.78 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  35.65 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0584  dehydratase  39.18 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  37.8 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6099  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.93 
 
 
482 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249001  normal  0.018881 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0052  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.75 
 
 
468 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70674  normal  0.03837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  31.78 
 
 
156 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  31.78 
 
 
140 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  31.78 
 
 
156 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3642  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
157 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.023327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  33.33 
 
 
139 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0588  MaoC-like dehydratase  36.28 
 
 
147 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0409  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.07 
 
 
480 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.935296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0357  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  39.78 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465716  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5041  dehydratase  39.44 
 
 
157 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0522475  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1955  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.04 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435715  normal  0.221917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2212  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  31.78 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.17 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.21 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  33.33 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1940  MaoC-like dehydratase  37.35 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.09 
 
 
471 aa  73.2  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1672  MaoC-like dehydratase  34.43 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  36.84 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>