93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2228 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2228  MaoC-like dehydratase  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4266  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  27.38 
 
 		 180 aa  91.3  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1284  MaoC-like dehydratase  31.28 
 
 		 318 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 418 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2892  GCN5-related N-acetyltransferase  24.39 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.928295  normal  0.0223783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13053  flagellin modification protein FlmH  24.55 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1968  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.549285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0658  hypothetical protein  32.87 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30991  normal  0.843566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3028  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  25.33 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2883  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0551656  normal  0.0742121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3074  hypothetical protein  24.83 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1723  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  23.87 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.845429  hitchhiker  0.000000591031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.263332  hitchhiker  0.00000000268657 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11238  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  23.19 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.579768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21710  hypothetical protein  29.25 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2212  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  23.91 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01540  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25.6 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0257601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3109  acetyltransferase  27.56 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0903  acetyltransferase  28.08 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.975526  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  30.71 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3328  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0699  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1851  hypothetical protein  28.04 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  23.86 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4742  acetyltransferase, GNAT family  22.92 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351729  normal  0.46007 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0400  acetyltransferase  28.68 
 
 		 157 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4798  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.75 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000254083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3436  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1575  GCN5-related N-acetyltransferase  25.45 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1322  N-acetyltransferase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  28.36 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000251242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2658  acetyltransferase  31.51 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0552  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2681  acetyltransferase  31.94 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000375724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  23.4 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2984  acetyltransferase, GNAT family  31.94 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000239405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2976  acetyltransferase  31.94 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0542861  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1508  acetyltransferase  27.13 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.364813  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1330  acetyltransferase  27.13 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2777  GCN5-related N-acetyltransferase  27.72 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2730  acetyltransferase  31.94 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2939  acetyltransferase  31.94 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00762348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2818  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0440  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.77 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4820  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.67 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2771  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0074365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2938  acetyltransferase, GNAT family  30.56 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70077e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2764  acetyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.824722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2533  acetyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000193156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5802  acetyltransferase, GNAT family  28.09 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.481451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2577  acetyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000295975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4825  ribosomal-protein-serine acetyltransferase, putative  29.67 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000648101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4913  acetyltransferase  27.27 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1337  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669514  normal  0.138984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  25.26 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3339  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0700  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2775  acetyltransferase, GNAT family  36.14 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  24.59 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0793594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2518  acetyltransferase, GNAT family  36.14 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0162592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1325  acetyltransferase-like protein  25.69 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0840  GCN5-related N-acetyltransferase  22.55 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000217088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3936  acetyltransferase  28.16 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2497  acetyltransferase  32.91 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000399882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  27.47 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  24.49 
 
 		 197 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0655  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2355  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  24.56 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2094  GCN5-related N-acetyltransferase  24.22 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  24.21 
 
 		 182 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  30.56 
 
 		 186 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0440  spermidine N1-acetyltransferase  25.79 
 
 		 178 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.321134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2797  acetyltransferase  32.5 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00286655  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  26.13 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4582  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.11 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4937  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.11 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>