34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0658 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0658  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  343  5e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30991  normal  0.843566 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2212  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  32.9 
 
 
162 aa  88.2  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0564  acetyltransferase  34.18 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1284  MaoC-like dehydratase  31.51 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2228  MaoC-like dehydratase  32.87 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1325  conserved hypothetical protein, possible N-acetyltransferase PseH  31.21 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0156164  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1322  N-acetyltransferase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  32.87 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000251242  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0400  acetyltransferase  30.94 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1330  acetyltransferase  29.5 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1508  acetyltransferase  29.5 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.364813  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1634  acetyltransferase  34.31 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1723  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  28.06 
 
 
186 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.845429  hitchhiker  0.000000591031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 
188 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.549285  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
195 aa  52  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
418 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3074  hypothetical protein  24.24 
 
 
201 aa  50.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2892  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.928295  normal  0.0223783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1968  GCN5-related N-acetyltransferase  24.6 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183643  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1196  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195338  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  26.89 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
163 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3086  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2436  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.48 
 
 
201 aa  44.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13053  flagellin modification protein FlmH  22.96 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0291  spermidine n1-acetyltransferase  31.11 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.858173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.57 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
170 aa  40.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.167561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>