More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0659 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0659  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 225 aa  470  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116739  normal  0.867777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 418 aa  238  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2224  putative methionyl-tRNA formyltransferase  44.39 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1323  conserved hypothetical protein, putative formyltransferase  37.33 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0072434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02909  probable methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0208  methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  31.58 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491531  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  29.41 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  29.21 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  26.63 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  25.77 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  26.98 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  27.01 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1256  putative formyltransferase  25.91 
 
 		 313 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201049  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1195  putative formyltransferase  26.42 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  0.263795 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1729  methionyl-tRNA formyltransferase  26.04 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  28.1 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  26.79 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  26.96 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2388  putative formyltransferase  25.27 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482791  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  24.75 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2096  hypothetical protein  27.56 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0619627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  27.63 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  29.46 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  25.66 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  25.81 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0438  putative formyltransferase  26.74 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.273297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1799  putative formyltransferase  26.2 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092642 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  25.66 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1320  putative formyltransferase  25.79 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0093  methionyl-tRNA formyltransferase  23.56 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  27.32 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  25.39 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  27.98 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0105  methionyl-tRNA formyltransferase  23.11 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0133  methionyl-tRNA formyltransferase  23.11 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3097  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  25.31 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0924  putative formyltransferase  25.95 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.343946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2691  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  26.95 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  28.06 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  22.58 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02899  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  27.22 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0140158  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  27.93 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  24.24 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2191  putative formyltransferase  25.62 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00205892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  26.67 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1771  putative formyltransferase  24.86 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  23.43 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  26.67 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1392  putative formyltransferase  25.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2403  putative formyltransferase  25.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1154  putative formyltransferase  25.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  25.13 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  29.01 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0015  putative formyltransferase  25.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4591  putative formyltransferase  25.22 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00877136  hitchhiker  0.00199709 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2277  putative formyltransferase  25.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  24 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1882  putative formyltransferase  25.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1799  putative formyltransferase  24.86 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  31.52 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_004310  BR0517  formyltransferase, putative  23.78 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0506  methionyl-tRNA formyltransferase  28.36 
 
 		 319 aa  53.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  22.04 
 
 		 314 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  25.85 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5162  putative formyltransferase  24.86 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2239  putative formyltransferase  25.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  28.18 
 
 		 333 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  27.78 
 
 		 312 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0521  putative formyltransferase  23.78 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  23.85 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18350  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  22.78 
 
 		 662 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  25.37 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  26.09 
 
 		 314 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  26.09 
 
 		 314 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  31.52 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  23.88 
 
 		 315 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  22.02 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  27.59 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  24.04 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  24.34 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  25.37 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2077  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  24.68 
 
 		 660 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2643  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  25.6 
 
 		 660 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  29.7 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  24.34 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  30.34 
 
 		 320 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  32.53 
 
 		 314 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  29.81 
 
 		 316 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  23.03 
 
 		 314 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2599  formyl transferase domain protein  23.95 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  30.56 
 
 		 302 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  25.43 
 
 		 311 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  25.37 
 
 		 306 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  35.14 
 
 		 325 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  26.28 
 
 		 331 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  24.34 
 
 		 314 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>