66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1373 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  57.75 
 
 
147 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2752  P2 GpU family protein  50.37 
 
 
161 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2488  phage protein gpU  50.37 
 
 
161 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0947  phage protein gpU  50 
 
 
160 aa  156  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.360304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  50.37 
 
 
162 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2843  phage P2 GpU family protein  49.63 
 
 
161 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3026  phage P2 GpU family protein  49.63 
 
 
161 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  53.33 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  52.94 
 
 
154 aa  150  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  50 
 
 
140 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  51.88 
 
 
149 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  51.85 
 
 
142 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1358  phage P2 GpU family protein  47.41 
 
 
161 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  50 
 
 
161 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  50 
 
 
159 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  50 
 
 
159 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  48.89 
 
 
154 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  49.25 
 
 
159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  52.67 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  46.04 
 
 
157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  45.26 
 
 
165 aa  141  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  48.95 
 
 
140 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  47.41 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  46.67 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  44.85 
 
 
164 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2669  P2 GpU family protein  43.15 
 
 
162 aa  130  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  47.2 
 
 
133 aa  127  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1326  Fels-2 prophage protein  46.4 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2587  P2 GpU family protein  43.65 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097389  hitchhiker  0.000000588078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2621  P2 GpU family protein  43.65 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000169007  hitchhiker  0.0000000282161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  43.65 
 
 
126 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  42.28 
 
 
136 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  37.6 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  36.8 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  36.8 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  36.51 
 
 
127 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  37.14 
 
 
306 aa  88.6  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  34.4 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  32 
 
 
152 aa  84.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  31.53 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0572  P2 GpU family protein  30.34 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  32.43 
 
 
281 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1487  Fels-2 prophage protein  31.45 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  29.13 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  30.51 
 
 
254 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4126  P2 GpU family protein  30.66 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0980822  normal  0.246483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  31.78 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  27.78 
 
 
289 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  29.73 
 
 
281 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  31.71 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  29.73 
 
 
281 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0252  phage tail protein, putative  31.15 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0506549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1149  Phage protein U-like  29.84 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107037  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  28.1 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  35.64 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  33.94 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  33.03 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2344  phage tail assembly protein  24.19 
 
 
139 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0168275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1570  P2 GpU family protein  28.85 
 
 
309 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.256457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2892  P2 GpU family protein  28.85 
 
 
305 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4548  putative methyl-accepting chemotaxis protein  28.71 
 
 
317 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.484485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4549  putative methyl-accepting chemotaxis protein  28.71 
 
 
317 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1218  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0699  hypothetical protein  23.53 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4464  putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.72 
 
 
317 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>