52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2344 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2344  phage tail assembly protein  100 
 
 		 139 aa  283  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0168275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1487  Fels-2 prophage protein  41.48 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0572  P2 GpU family protein  34.65 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4126  P2 GpU family protein  34.56 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0980822  normal  0.246483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  34.04 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  29.84 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  30.36 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  27.2 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  30.19 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  28.57 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  29.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  28.57 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  29.69 
 
 		 289 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  26.4 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  25.45 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  26.21 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  29.67 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  25.77 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  29.67 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  25 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  24.41 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  23.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  26.61 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  26.21 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  23.62 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  28.71 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  24.19 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  26.09 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  27.47 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  27.47 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  32.86 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  34.29 
 
 		 281 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  28.41 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  28.41 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  28.41 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  24.6 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  28.32 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  21.95 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  28.71 
 
 		 254 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2621  P2 GpU family protein  25.81 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000169007  hitchhiker  0.0000000282161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2587  P2 GpU family protein  25.81 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097389  hitchhiker  0.000000588078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2892  P2 GpU family protein  24.37 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1149  Phage protein U-like  23.85 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  24.35 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1358  phage P2 GpU family protein  26 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3026  phage P2 GpU family protein  27.47 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2843  phage P2 GpU family protein  27.47 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1570  P2 GpU family protein  24.37 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.256457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4548  putative methyl-accepting chemotaxis protein  22.22 
 
 		 317 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.484485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4549  putative methyl-accepting chemotaxis protein  22.22 
 
 		 317 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0696  putative phage tail protein  30.84 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  27.47 
 
 		 281 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>