55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4036 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  58.27 
 
 		 254 aa  314  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  52.67 
 
 		 281 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  53.02 
 
 		 281 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  46.88 
 
 		 289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  45.67 
 
 		 290 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  39.92 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  47.06 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  41.46 
 
 		 136 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  35.29 
 
 		 126 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  32.79 
 
 		 152 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  32.5 
 
 		 127 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  36.28 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  32.77 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  32.77 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  31.93 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2621  P2 GpU family protein  30.97 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000169007  hitchhiker  0.0000000282161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2587  P2 GpU family protein  30.97 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097389  hitchhiker  0.000000588078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  30.97 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  26.67 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  28.83 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  29.73 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  26.67 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  26.32 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  28.33 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  28.83 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  29.2 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  30.77 
 
 		 116 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  26.13 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  30 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  24.39 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  30.91 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  26.13 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  27.05 
 
 		 165 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0947  phage protein gpU  25.2 
 
 		 160 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.360304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2752  P2 GpU family protein  25.2 
 
 		 161 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  23.89 
 
 		 162 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2488  phage protein gpU  25.2 
 
 		 161 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  23.33 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1358  phage P2 GpU family protein  27.03 
 
 		 161 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2669  P2 GpU family protein  26.45 
 
 		 162 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1326  Fels-2 prophage protein  24.17 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0699  hypothetical protein  28.79 
 
 		 142 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  24.78 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  25.2 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  24 
 
 		 164 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  24.39 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  28 
 
 		 141 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  23.58 
 
 		 154 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0252  phage tail protein, putative  28.83 
 
 		 124 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0506549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  24.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2424  hypothetical protein  35.14 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810689  normal  0.176003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  27.35 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  27.2 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  27.64 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>