58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2890 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  100 
 
 		 149 aa  303  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  64 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  64 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  63.2 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2488  phage protein gpU  53.75 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2752  P2 GpU family protein  58.65 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3026  phage P2 GpU family protein  62.4 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2843  phage P2 GpU family protein  62.4 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0947  phage protein gpU  58.33 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.360304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1358  phage P2 GpU family protein  60.8 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  54.55 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  56.39 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  55.64 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  60 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  52.94 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  52.59 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  51.01 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  51.05 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  50.35 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  50.35 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  51.88 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  53.73 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  54.4 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  52.8 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  49.62 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  45.19 
 
 		 164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2669  P2 GpU family protein  48.8 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1326  Fels-2 prophage protein  44.85 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  44.8 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2587  P2 GpU family protein  47.2 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097389  hitchhiker  0.000000588078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2621  P2 GpU family protein  47.2 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000169007  hitchhiker  0.0000000282161 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  35.94 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  35.94 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  35.16 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  34.92 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  38.66 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  35.38 
 
 		 136 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  34.13 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1487  Fels-2 prophage protein  33.87 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  37.69 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  31.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4126  P2 GpU family protein  33.05 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0980822  normal  0.246483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  33.06 
 
 		 289 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2344  phage tail assembly protein  34.04 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0168275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  28.69 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  31.45 
 
 		 290 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  29.66 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  33.85 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  33.08 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0572  P2 GpU family protein  26.19 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  26.79 
 
 		 281 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  28.1 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  29.92 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  29.13 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  26.55 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  25.66 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  24.78 
 
 		 281 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0696  putative phage tail protein  34.04 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>