14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0696 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0696  putative phage tail protein  100 
 
 		 121 aa  247  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1487  Fels-2 prophage protein  31.15 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  28.1 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  27.27 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  32.1 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  26.89 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  26.89 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  26.89 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  27.78 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  29.51 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  27.87 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  27.87 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  34.04 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2344  phage tail assembly protein  30.84 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0168275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>