61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  100 
 
 
147 aa  291  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  57.75 
 
 
147 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  63.36 
 
 
149 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  59.7 
 
 
154 aa  170  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  57.46 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3026  phage P2 GpU family protein  54.29 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2843  phage P2 GpU family protein  54.29 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  56.72 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1358  phage P2 GpU family protein  52.86 
 
 
161 aa  159  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  57.46 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  57.04 
 
 
140 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2752  P2 GpU family protein  52.86 
 
 
161 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2488  phage protein gpU  52.86 
 
 
161 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0947  phage protein gpU  52.52 
 
 
160 aa  156  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.360304  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  56.82 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  51.01 
 
 
149 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  51.41 
 
 
165 aa  149  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  54.35 
 
 
161 aa  147  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  54.48 
 
 
159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  53.62 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  50.72 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1326  Fels-2 prophage protein  53.97 
 
 
141 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  56 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  52.9 
 
 
159 aa  143  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  49.3 
 
 
162 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  52.86 
 
 
154 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  49.25 
 
 
140 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2587  P2 GpU family protein  54.4 
 
 
146 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097389  hitchhiker  0.000000588078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2621  P2 GpU family protein  54.4 
 
 
146 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000169007  hitchhiker  0.0000000282161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  48.57 
 
 
164 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2669  P2 GpU family protein  46.83 
 
 
162 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  45.67 
 
 
160 aa  121  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  45.67 
 
 
160 aa  121  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  44.88 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  44.8 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  37.59 
 
 
306 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  39.02 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  37.3 
 
 
127 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  36.8 
 
 
155 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  30.16 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  33.61 
 
 
292 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  32.84 
 
 
289 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  32.81 
 
 
290 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  32.77 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  31.09 
 
 
281 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  31.09 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1487  Fels-2 prophage protein  30.65 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  34.17 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  28.83 
 
 
281 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  32.28 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  33.07 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  30.58 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4126  P2 GpU family protein  27.87 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0980822  normal  0.246483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0572  P2 GpU family protein  25 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  33.33 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  32.5 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0252  phage tail protein, putative  29.51 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0506549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1149  Phage protein U-like  28.23 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107037  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2344  phage tail assembly protein  25 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0168275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4549  putative methyl-accepting chemotaxis protein  31.07 
 
 
317 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4548  putative methyl-accepting chemotaxis protein  31.07 
 
 
317 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.484485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>