59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2044 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  100 
 
 		 152 aa  316  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  35.61 
 
 		 306 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  35.88 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  33.87 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  32.54 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  32.54 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  30 
 
 		 155 aa  88.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  31.75 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  35.16 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  32.79 
 
 		 281 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  33.85 
 
 		 289 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  32 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  31.97 
 
 		 292 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  32.82 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  30.95 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  30.16 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  29.51 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  28.69 
 
 		 281 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1326  Fels-2 prophage protein  29.92 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  27.87 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2621  P2 GpU family protein  28.68 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000169007  hitchhiker  0.0000000282161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2587  P2 GpU family protein  28.68 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097389  hitchhiker  0.000000588078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  28 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  26.77 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  28 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  25.78 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  25.78 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  29.13 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  27.34 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  27.2 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  25.78 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  25.78 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3026  phage P2 GpU family protein  26.36 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288409 
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  30.08 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2843  phage P2 GpU family protein  26.36 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  26.52 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2752  P2 GpU family protein  24.03 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0947  phage protein gpU  24.22 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.360304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  24.41 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2488  phage protein gpU  24.03 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1358  phage P2 GpU family protein  24.22 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  26.56 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  28.69 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  22.83 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  25.95 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  27.34 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  27.34 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2669  P2 GpU family protein  26.77 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  23.62 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  23.62 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0699  hypothetical protein  25.19 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  27.48 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  27.56 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  25.98 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1487  Fels-2 prophage protein  18.18 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1570  P2 GpU family protein  24.62 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.256457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4548  putative methyl-accepting chemotaxis protein  22.05 
 
 		 317 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.484485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4549  putative methyl-accepting chemotaxis protein  22.05 
 
 		 317 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2892  P2 GpU family protein  23.62 
 
 		 305 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>