51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08130 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  90.34 
 
 		 289 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  50.38 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  50.52 
 
 		 281 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  47.4 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  45.67 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  43.05 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  40.15 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  36.72 
 
 		 126 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  32.82 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  34.4 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  35.66 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  33.07 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  32.81 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  32.56 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  32.59 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  32.56 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  36.36 
 
 		 133 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  31.01 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  31.78 
 
 		 130 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0699  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  29.13 
 
 		 147 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  31.3 
 
 		 164 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  35.16 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2587  P2 GpU family protein  31.78 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097389  hitchhiker  0.000000588078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2621  P2 GpU family protein  31.78 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000169007  hitchhiker  0.0000000282161 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  35.16 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  34.38 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  30.53 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1326  Fels-2 prophage protein  30.23 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  31.45 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  32.06 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  28.15 
 
 		 154 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  28.35 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  27.91 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  27.91 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  27.91 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  30.23 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  28.79 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  32.38 
 
 		 116 aa  53.1  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2344  phage tail assembly protein  29.46 
 
 		 139 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0168275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  28.35 
 
 		 149 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  25.98 
 
 		 142 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  30.53 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  29.77 
 
 		 141 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  28.68 
 
 		 154 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  27.91 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  29.37 
 
 		 141 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0252  phage tail protein, putative  26.19 
 
 		 124 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0506549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2669  P2 GpU family protein  27.27 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4126  P2 GpU family protein  25.86 
 
 		 141 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0980822  normal  0.246483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>