57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2351 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  100 
 
 		 154 aa  316  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  98.7 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  95.45 
 
 		 154 aa  300  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2752  P2 GpU family protein  60.25 
 
 		 161 aa  204  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2488  phage protein gpU  60.25 
 
 		 161 aa  204  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0947  phage protein gpU  60 
 
 		 160 aa  202  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.360304  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3026  phage P2 GpU family protein  58.75 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2843  phage P2 GpU family protein  59.21 
 
 		 161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1358  phage P2 GpU family protein  61.49 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  59.87 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  55.7 
 
 		 159 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  55.7 
 
 		 159 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  54.36 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  55.78 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  55.26 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  54.36 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  63.2 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  57.46 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  58.04 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  56.72 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  57.48 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  52.52 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  53.6 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  52 
 
 		 142 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  50 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2669  P2 GpU family protein  45.81 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  46.67 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  45.6 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1326  Fels-2 prophage protein  38.58 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2621  P2 GpU family protein  42.86 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000169007  hitchhiker  0.0000000282161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2587  P2 GpU family protein  42.86 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097389  hitchhiker  0.000000588078 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  37.6 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  37.6 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  36.8 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  39.5 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  36 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  34.71 
 
 		 306 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  31.54 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  30.33 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1487  Fels-2 prophage protein  28.12 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  23.62 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2291  phage P2 GpU family protein  30 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  26.83 
 
 		 292 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  28.33 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  29.17 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  31.4 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  27.03 
 
 		 281 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  30.58 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  27.91 
 
 		 290 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  27.34 
 
 		 289 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  23.58 
 
 		 281 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  26.13 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2344  phage tail assembly protein  27.47 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0168275  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  38.27 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0572  P2 GpU family protein  27.78 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4126  P2 GpU family protein  24.35 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0980822  normal  0.246483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  22.76 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>