48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2508 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  100 
 
 		 130 aa  268  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  98.46 
 
 		 130 aa  266  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2424  hypothetical protein  82.89 
 
 		 90 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810689  normal  0.176003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1149  Phage protein U-like  46.03 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02000  hypothetical protein  40.6 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  39.53 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  35.94 
 
 		 289 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  39.06 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  39.06 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  31.4 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  31.78 
 
 		 290 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  33.33 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  31.78 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  31.97 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  33.07 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  35.94 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  33.33 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  33.33 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  29.92 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  31.67 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  30.91 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  31.67 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3063  pyocin R2_PP, tail formation protein  33.33 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0949422  normal  0.702091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  31.67 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  30.95 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  30.83 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  33.33 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  30.65 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2192  phage P2 GpU  32.23 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  29.46 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2304  P2 GpU family protein  31.4 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  28.18 
 
 		 254 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2351  P2 GpU family protein  31.4 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1326  Fels-2 prophage protein  31.75 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  28.91 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4388  gp25  27.05 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.0446895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  25.98 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2890  P2 GpU family protein  29.13 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  31.45 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  28.24 
 
 		 292 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  27.05 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  30.58 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  31.01 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0947  phage protein gpU  28.69 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.360304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  28.8 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2488  phage protein gpU  28.69 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2752  P2 GpU family protein  28.69 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0699  hypothetical protein  25.36 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>