28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1149 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1149  Phage protein U-like  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  46.83 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  46.03 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02000  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  29.84 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  28 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  28.57 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  28.23 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4861  P2 GpU family protein  28.57 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0393756  normal  0.239342 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  25 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  24 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  26.4 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2424  hypothetical protein  35.44 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810689  normal  0.176003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  27.73 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1154  P2 GpU family protein  28.23 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  25.6 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  27.27 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  25.6 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  25.81 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0393  phage-related tail protein  28.23 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1132  phage-related tail protein  28.23 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  25.2 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  25.98 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2344  phage tail assembly protein  23.85 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0168275  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0569  prophage P2W3, tail protein U, putative  21.5 
 
 		 116 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  26.98 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  23.13 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  26.23 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>