19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0699 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0699  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  296  9e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  28.03 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  31.82 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3357  putative phage tail protein U  29.32 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0883  P2 GpU family protein  29.63 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0387596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2044  P2 GpU family protein  25.19 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1216  P2 GpU family protein  28.89 
 
 		 281 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473428  hitchhiker  0.000809391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  28.79 
 
 		 281 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1625  putative phage tail protein U  26.09 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  27.03 
 
 		 292 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3321  phage P2 GpU  25.76 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3392  hypothetical protein  25.58 
 
 		 254 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2373  phage P2 GpU  24.24 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  23.53 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2500  phage P2 GpU family protein  26.09 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  35.71 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2508  phage P2 GpU family protein  25.36 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>