28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0252 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0252  phage tail protein, putative  100 
 
 		 124 aa  249  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0506549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3197  P2 GpU family protein  33.94 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00170121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1373  phage P2 GpU  31.15 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1913  phage-like tail protein  31.71 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1856  phage P2 GpU family protein  27.19 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2104  P2 GpU family protein  35.2 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37350  Phage P2 GpU protein  29.51 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3314  phage P2 GpU family protein  29.91 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1280  phage P2 GpU  26.45 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0997  phage protein gpU  32.43 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.876924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0180  P2 GpU family protein  28 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.758834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4350  phage protein gpU  32.43 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.356876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0858  P2 GpU family protein  29.09 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000438995  hitchhiker  0.000950606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0770  hypothetical protein  24.8 
 
 		 289 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08130  hypothetical protein  26.19 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000129045  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3025  phage protein gpU  31.53 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4036  P2 GpU family protein  28.83 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000894 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1810  P2 GpU family protein  32.8 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1358  phage P2 GpU family protein  26.45 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2659  P2 GpU family protein  25.41 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2752  P2 GpU family protein  25 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2843  phage P2 GpU family protein  26.92 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3026  phage P2 GpU family protein  26.92 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288409 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0947  phage protein gpU  25 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.360304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2488  phage protein gpU  25 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01339  gpU  27.36 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3477  phage P2 GpU family protein  28.69 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.305827  normal  0.204927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0751  hypothetical protein  31.13 
 
 		 306 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480135  normal  0.20515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>