More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1602 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
206 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  85.56 
 
 
206 aa  335  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.879675  normal  0.609652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0748  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  76.47 
 
 
215 aa  314  6e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0663898  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  76.92 
 
 
228 aa  313  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000162205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1868  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.82 
 
 
214 aa  303  9.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  76.11 
 
 
204 aa  300  8.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.478766  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  76.33 
 
 
200 aa  287  9e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.7 
 
 
513 aa  200  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.37 
 
 
507 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2619  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I  45.81 
 
 
427 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487115  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1026  hypothetical protein  37.93 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.98 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.04 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.56 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  28.07 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  28.07 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.61 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.22 
 
 
165 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  25.62 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  30.52 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  32.28 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  33.88 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  33.88 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  27.49 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.81 
 
 
270 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  28.07 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  28.07 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  27.49 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.81 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.09 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.54 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.56 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.57 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.05 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.65 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.33 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  30.38 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  27.59 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  27.59 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  27.59 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  27.59 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  30.67 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  33.06 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  33.06 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  28.16 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  33.06 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  33.79 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  30.89 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2993  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.82 
 
 
440 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  29.11 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.26 
 
 
234 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  28.92 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  30.89 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  30.89 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  27.59 
 
 
182 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  32.48 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.32 
 
 
216 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  28.19 
 
 
207 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  34.15 
 
 
179 aa  62  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  27.22 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.68 
 
 
216 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.76 
 
 
175 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  30.33 
 
 
180 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.77 
 
 
185 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.15 
 
 
171 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  30.94 
 
 
139 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 
171 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.66 
 
 
449 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  26.58 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  29.27 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  29.27 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  29.27 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  32.23 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  29.01 
 
 
139 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 
139 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4515  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.71 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  27.49 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.79 
 
 
254 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  29.77 
 
 
139 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.84 
 
 
170 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.3 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  26.51 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  25.95 
 
 
177 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.42 
 
 
234 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.78 
 
 
167 aa  58.2  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  28.46 
 
 
180 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>