More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0420 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  100 
 
 
471 aa  966    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  65.25 
 
 
472 aa  600  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  59.91 
 
 
478 aa  588  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  59.44 
 
 
467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  58.71 
 
 
470 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  62.69 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  58.67 
 
 
470 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  47.36 
 
 
467 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  46.48 
 
 
462 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  48.91 
 
 
462 aa  415  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  48.83 
 
 
464 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  45.03 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  46.9 
 
 
462 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  44.42 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  47 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  45.06 
 
 
462 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  45.44 
 
 
468 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.59 
 
 
464 aa  350  2e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  39.13 
 
 
450 aa  312  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  37.44 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  36.7 
 
 
448 aa  263  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  32.97 
 
 
458 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  32.98 
 
 
452 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  33.33 
 
 
450 aa  246  9e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  32.69 
 
 
480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.22 
 
 
456 aa  212  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  31.85 
 
 
454 aa  200  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  27.67 
 
 
460 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.63 
 
 
452 aa  187  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  29.26 
 
 
458 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.69 
 
 
453 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.22 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
454 aa  179  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.46 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  27.46 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  29.57 
 
 
454 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  29.59 
 
 
468 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  26.85 
 
 
434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  26.58 
 
 
449 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  26.94 
 
 
465 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  26.94 
 
 
466 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  27.16 
 
 
463 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.51 
 
 
447 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  26 
 
 
475 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  26.51 
 
 
466 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  27.85 
 
 
430 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  28.91 
 
 
437 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  29.31 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  27.6 
 
 
457 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  28.71 
 
 
437 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.02 
 
 
430 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  26.57 
 
 
782 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  28.02 
 
 
457 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.91 
 
 
463 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  29.34 
 
 
446 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  27.43 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  28.57 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  26.33 
 
 
863 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  27.81 
 
 
462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  26.45 
 
 
465 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  25.59 
 
 
469 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  25 
 
 
462 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  28.19 
 
 
444 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  27.49 
 
 
449 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  25.32 
 
 
782 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  26.74 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  28.04 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  27.59 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  28.21 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  26.4 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  26.6 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  25.65 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  26.5 
 
 
881 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  29.85 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  26.45 
 
 
465 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  26.82 
 
 
471 aa  141  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  27.35 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  26.7 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  26.82 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  26.11 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.97 
 
 
416 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  26.57 
 
 
465 aa  140  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  26.12 
 
 
488 aa  139  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  26.3 
 
 
461 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.42 
 
 
437 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  26.25 
 
 
442 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  25.86 
 
 
461 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  27.67 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  25.99 
 
 
460 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  27.71 
 
 
451 aa  137  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  26.98 
 
 
469 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  28.57 
 
 
447 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  26.54 
 
 
854 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  26.67 
 
 
474 aa  136  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.91 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  27.64 
 
 
453 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.63 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  25.05 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  25.91 
 
 
868 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>