More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0423 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 
478 aa  976    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  68.16 
 
 
470 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  69.51 
 
 
467 aa  672    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  70.88 
 
 
492 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.87 
 
 
470 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  61.86 
 
 
472 aa  570  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  59.91 
 
 
471 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  47.28 
 
 
462 aa  430  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  45.4 
 
 
467 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  47.28 
 
 
462 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.03 
 
 
462 aa  409  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  45.88 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  45.82 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  48.21 
 
 
464 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  45.42 
 
 
468 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  46.09 
 
 
462 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  45.24 
 
 
460 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.01 
 
 
464 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  38.98 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  36.9 
 
 
478 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  31.61 
 
 
452 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  31.67 
 
 
458 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  33.77 
 
 
448 aa  238  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  33.77 
 
 
480 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
450 aa  228  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  30.57 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.57 
 
 
456 aa  187  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  31.22 
 
 
446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  28.72 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  28.72 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  29.45 
 
 
458 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.11 
 
 
433 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  31.25 
 
 
437 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.37 
 
 
447 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.78 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  30.39 
 
 
454 aa  173  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.87 
 
 
452 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  30.29 
 
 
437 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  28.79 
 
 
430 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  27.87 
 
 
434 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  29.64 
 
 
454 aa  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  28.03 
 
 
449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.24 
 
 
430 aa  163  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  29.45 
 
 
434 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.57 
 
 
430 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.22 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  27.96 
 
 
468 aa  156  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  29.68 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  29.52 
 
 
445 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27 
 
 
442 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  27.21 
 
 
472 aa  150  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.87 
 
 
437 aa  150  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.58 
 
 
418 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  27.62 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1447  phosphoglucomutase/phosphomannomutase subunit alpha/beta  28.75 
 
 
432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  28.42 
 
 
452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  27.76 
 
 
451 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  28.05 
 
 
416 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.38 
 
 
463 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  27.46 
 
 
460 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  26.89 
 
 
466 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  28.97 
 
 
474 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  27.9 
 
 
446 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  29.13 
 
 
449 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  26.67 
 
 
463 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  27.58 
 
 
782 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  26.67 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  27.31 
 
 
442 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  27.68 
 
 
457 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  28.84 
 
 
469 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  27.47 
 
 
462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  27 
 
 
462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  26.55 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  25.68 
 
 
467 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  26.07 
 
 
465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  26.51 
 
 
461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  26.07 
 
 
465 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  26.24 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  27.58 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  23.74 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  25.97 
 
 
854 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  25.81 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  25.97 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.12 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  25.75 
 
 
868 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  24.95 
 
 
462 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  26.71 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  27.15 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  25.68 
 
 
462 aa  133  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  25.22 
 
 
863 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  26.5 
 
 
451 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27 
 
 
439 aa  133  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  25.98 
 
 
478 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  27.37 
 
 
471 aa  133  9e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.34 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  27.8 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.99 
 
 
416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  26.28 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  25.2 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  26.38 
 
 
881 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>