More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0454 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  65.32 
 
 
470 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  100 
 
 
467 aa  961    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  69.51 
 
 
478 aa  672    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  63.36 
 
 
470 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  66.88 
 
 
492 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.95 
 
 
472 aa  558  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  59.44 
 
 
471 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  47.74 
 
 
462 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  48.09 
 
 
462 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  46.85 
 
 
458 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  50.22 
 
 
464 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  46.04 
 
 
467 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.32 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  45.84 
 
 
467 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  46.9 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  47.64 
 
 
460 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  45.44 
 
 
468 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.58 
 
 
464 aa  364  2e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  39.78 
 
 
450 aa  307  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  35.79 
 
 
478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  33.85 
 
 
448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  31.47 
 
 
452 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  31.37 
 
 
458 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  34.83 
 
 
480 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  31.52 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  30.32 
 
 
455 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.24 
 
 
456 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.79 
 
 
433 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  29.25 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  30.39 
 
 
454 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.37 
 
 
453 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  27.7 
 
 
455 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  29.33 
 
 
430 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  29.74 
 
 
458 aa  176  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.27 
 
 
452 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  28.57 
 
 
434 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  30.69 
 
 
454 aa  170  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  27.56 
 
 
446 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.6 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  28.27 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.67 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  30.77 
 
 
468 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  29.65 
 
 
454 aa  163  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  29.55 
 
 
457 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  27.73 
 
 
437 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.81 
 
 
447 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  27.25 
 
 
437 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  28.19 
 
 
466 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  28.19 
 
 
463 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.94 
 
 
453 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  28.1 
 
 
449 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  29.89 
 
 
459 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  28.48 
 
 
457 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  28.48 
 
 
466 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  28.38 
 
 
469 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  27.56 
 
 
458 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  27.9 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  27.99 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  28.44 
 
 
471 aa  147  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  27.11 
 
 
461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  27.64 
 
 
465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  28.44 
 
 
471 aa  146  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  28.1 
 
 
467 aa  146  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  26.14 
 
 
465 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.51 
 
 
442 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  27.59 
 
 
782 aa  143  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  26.74 
 
 
863 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  28.83 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  27.85 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.22 
 
 
418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  28.36 
 
 
456 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  28.35 
 
 
461 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.25 
 
 
463 aa  140  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.87 
 
 
437 aa  140  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  26.58 
 
 
462 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  28.84 
 
 
451 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  26.07 
 
 
455 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  26.12 
 
 
450 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  26.59 
 
 
461 aa  139  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  28.27 
 
 
497 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  26.74 
 
 
461 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  27.85 
 
 
444 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  28.32 
 
 
465 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  26.91 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  28.27 
 
 
451 aa  137  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  27.66 
 
 
462 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  29.16 
 
 
446 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  25.93 
 
 
462 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  27.89 
 
 
782 aa  136  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  28.17 
 
 
460 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  29.69 
 
 
447 aa  136  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  26.14 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  29.19 
 
 
419 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  30.51 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  26.68 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  27.77 
 
 
469 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  27.13 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  28.39 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  27.43 
 
 
868 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  26.68 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>