More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08836 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  70.72 
 
 
464 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  75.43 
 
 
462 aa  694    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  100 
 
 
462 aa  942    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  65.8 
 
 
462 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  61.47 
 
 
467 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  59.78 
 
 
467 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  62.39 
 
 
468 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  58.61 
 
 
462 aa  553  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  59.25 
 
 
460 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  53.59 
 
 
464 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  49.56 
 
 
458 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.32 
 
 
467 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.03 
 
 
478 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.63 
 
 
470 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  46.54 
 
 
470 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  48.91 
 
 
471 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.53 
 
 
472 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.33 
 
 
492 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  40.79 
 
 
450 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  39.47 
 
 
478 aa  319  6e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  38.63 
 
 
452 aa  292  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  37.31 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  35.95 
 
 
448 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  35.38 
 
 
450 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  34.55 
 
 
480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.79 
 
 
452 aa  217  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  32.98 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.7 
 
 
453 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.62 
 
 
456 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  32.82 
 
 
454 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  30.2 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  31.69 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  30.84 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.31 
 
 
453 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  29.62 
 
 
450 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  32.1 
 
 
449 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  30.55 
 
 
475 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  32.33 
 
 
459 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  31.47 
 
 
466 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  29.96 
 
 
434 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  31.03 
 
 
463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  31.03 
 
 
466 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  30.72 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  27.94 
 
 
460 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  31.28 
 
 
434 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  30.51 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  31.25 
 
 
458 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  30.58 
 
 
465 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  30.73 
 
 
465 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  29.04 
 
 
449 aa  179  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  29.84 
 
 
444 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  30.73 
 
 
465 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  31.36 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  29.71 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  29.81 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.48 
 
 
433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  31.67 
 
 
782 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  31.19 
 
 
446 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  28.88 
 
 
430 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  30.4 
 
 
468 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  29.19 
 
 
854 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  29.78 
 
 
456 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  28.35 
 
 
868 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.02 
 
 
463 aa  170  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.4 
 
 
437 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  29.67 
 
 
455 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  29.43 
 
 
472 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  28.95 
 
 
488 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.4 
 
 
430 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  31.41 
 
 
467 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  28.64 
 
 
466 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  29.91 
 
 
863 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  27.58 
 
 
461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.88 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.8 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  29.45 
 
 
881 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.4 
 
 
430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  27.23 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  27.68 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  28.64 
 
 
448 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  28.97 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  27.6 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  28.33 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  28.17 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  29.36 
 
 
464 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  28.79 
 
 
465 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  28.79 
 
 
462 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  27.99 
 
 
472 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  29.56 
 
 
468 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  31.5 
 
 
445 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  28.63 
 
 
471 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  27.43 
 
 
461 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  28.63 
 
 
471 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  29.29 
 
 
453 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  28.92 
 
 
447 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  28.17 
 
 
497 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  27.92 
 
 
446 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  28.85 
 
 
462 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  27.23 
 
 
446 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  29.39 
 
 
460 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>