More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1905 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  100 
 
 		 461 aa  956    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  55.92 
 
 		 457 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  53.81 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  53.36 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  53.56 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  54.62 
 
 		 462 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  54.41 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  54.61 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  54.64 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  53.35 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  51.82 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  54.29 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  51.61 
 
 		 485 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  52.48 
 
 		 461 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  51.52 
 
 		 469 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  51.07 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  52.27 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  52.62 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  50.75 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  50.32 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  51.2 
 
 		 881 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  53.74 
 
 		 460 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  50.86 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  51.09 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  52.85 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  51.63 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  50.64 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  52.67 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  50.22 
 
 		 854 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  51.19 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  49.46 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  50.65 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  52.25 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  52.25 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  52.25 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  50 
 
 		 868 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  52.03 
 
 		 464 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  52.25 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  51.19 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  50.76 
 
 		 863 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  52.25 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  52.25 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  51.39 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  50.22 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  52.11 
 
 		 782 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  51.61 
 
 		 489 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  51.61 
 
 		 489 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  49.68 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  50.89 
 
 		 486 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  52.25 
 
 		 961 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  50.11 
 
 		 488 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  50.87 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  51.39 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  50.96 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  50.96 
 
 		 487 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  50.76 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  49.47 
 
 		 475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  49.67 
 
 		 472 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  50.22 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  49.13 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  49.78 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  48.82 
 
 		 782 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  47.03 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  47.03 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  46.83 
 
 		 830 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  47.82 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  45.43 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  45.22 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  44.62 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  45 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  42.92 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  41.72 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  42.76 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  41.65 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  42.67 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  43.02 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.8 
 
 		 847 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  42.86 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  42.58 
 
 		 495 aa  360  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  42.79 
 
 		 453 aa  359  6e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  38.69 
 
 		 475 aa  356  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  41.32 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  42.5 
 
 		 464 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  41.39 
 
 		 453 aa  344  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  41.24 
 
 		 474 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  39.37 
 
 		 455 aa  339  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  40.67 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  37.94 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  40.22 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  40.09 
 
 		 472 aa  329  7e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  39.52 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  39.69 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  38.51 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  39.09 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  38.9 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  36.62 
 
 		 460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  39.73 
 
 		 468 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  34.75 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1799  Phosphomannomutase  34.91 
 
 		 456 aa  269  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  34.88 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>