More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2856 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  74.04 
 
 		 467 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  100 
 
 		 468 aa  952    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  69.83 
 
 		 462 aa  631  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  65.3 
 
 		 467 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  66.81 
 
 		 460 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  64.29 
 
 		 462 aa  569  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  62.39 
 
 		 462 aa  561  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  60.3 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  55.6 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  53.98 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  48.71 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.42 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  45.44 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.4 
 
 		 470 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  44.19 
 
 		 470 aa  392  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  45.44 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.97 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.54 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  39.02 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  38.61 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  34.93 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  33.26 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  33.26 
 
 		 458 aa  222  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  33.41 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  33.11 
 
 		 480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.92 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  30.28 
 
 		 455 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  31.67 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.38 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  27.55 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.56 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  30.57 
 
 		 466 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  30.57 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  30.34 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  30.19 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  30.33 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  30.41 
 
 		 462 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  29.95 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  30.07 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  31.63 
 
 		 868 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  28.42 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  30.96 
 
 		 854 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  29.06 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  29.98 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  30.56 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  30.94 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  29.74 
 
 		 457 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  28.79 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  29.95 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  30.25 
 
 		 465 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.47 
 
 		 453 aa  159  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  30.42 
 
 		 461 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  28.4 
 
 		 469 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  30.07 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  29.28 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  29.82 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  30.71 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  28.73 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  30 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.79 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  30.02 
 
 		 782 aa  156  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  27.47 
 
 		 437 aa  156  9e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  29.44 
 
 		 863 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  26.39 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  30.14 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  26.91 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  29.56 
 
 		 461 aa  153  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 444 aa  153  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  31.03 
 
 		 445 aa  153  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  32.24 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  31.44 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  28.3 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.34 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  29.61 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  28.94 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  28.54 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  28.44 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  30.41 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.54 
 
 		 433 aa  150  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  28.17 
 
 		 458 aa  150  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  29.08 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  28.63 
 
 		 463 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  29.07 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  27.66 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  29.55 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  29.14 
 
 		 881 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  28.1 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  29.11 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  30.02 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  30.34 
 
 		 733 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  30.81 
 
 		 497 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  29 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  26.37 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  27.06 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  29.57 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  30.92 
 
 		 449 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  29.28 
 
 		 456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  30.92 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  27.35 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  29.93 
 
 		 456 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>