More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1412 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  71.06 
 
 		 467 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  67.54 
 
 		 467 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 462 aa  931    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  69.83 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  67.83 
 
 		 462 aa  624  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  67.32 
 
 		 460 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  65.8 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  62.77 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  63.42 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  55.12 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  46.9 
 
 		 467 aa  435  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  47.38 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.57 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.09 
 
 		 478 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  45.97 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  46.9 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.76 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.97 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  40.13 
 
 		 478 aa  317  4e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  38.82 
 
 		 450 aa  312  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  35.24 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  35.36 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  34.84 
 
 		 452 aa  246  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  35.84 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  33.11 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.17 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.63 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.69 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  29.63 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  31.66 
 
 		 455 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.65 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  30.53 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  30.97 
 
 		 449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  31.61 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  30.11 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  31.82 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  29.93 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.14 
 
 		 433 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  27.21 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  31.1 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  30.11 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  32.63 
 
 		 469 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  31.09 
 
 		 475 aa  173  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  30.24 
 
 		 782 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  30.24 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  28.67 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  29.58 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  32.08 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  30.43 
 
 		 457 aa  170  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  27.92 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  31.85 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  29.57 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  30.24 
 
 		 465 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  30.65 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  28.88 
 
 		 458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  30.73 
 
 		 465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  29.11 
 
 		 459 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  30.56 
 
 		 466 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  29.07 
 
 		 854 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  27.42 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  29.95 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  31.75 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.86 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  30.32 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  27.56 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  29.95 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  29.04 
 
 		 868 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  29.19 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  31.05 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  31.05 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  29.68 
 
 		 863 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  28.33 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  28.54 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  28.33 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  30.19 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  28.9 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.1 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  27.7 
 
 		 782 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  30.52 
 
 		 453 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  28.7 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  29.25 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  28.89 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  29.44 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.33 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.28 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.85 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  27.44 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  28.61 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  28.67 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  29.71 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.67 
 
 		 442 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  29.57 
 
 		 465 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  28.83 
 
 		 456 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  30.84 
 
 		 454 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  29.93 
 
 		 465 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  28.5 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  30.12 
 
 		 464 aa  156  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  29.47 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  29.3 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>