More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1094 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  100 
 
 
462 aa  946    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  62.77 
 
 
462 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  58.61 
 
 
462 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  59.57 
 
 
464 aa  523  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  58.61 
 
 
462 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  56.06 
 
 
467 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  55.53 
 
 
467 aa  505  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  53.98 
 
 
468 aa  482  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  53.49 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  48.58 
 
 
458 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.28 
 
 
478 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.74 
 
 
464 aa  429  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.74 
 
 
467 aa  428  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.28 
 
 
470 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.57 
 
 
470 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  46.48 
 
 
471 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.13 
 
 
492 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.83 
 
 
472 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  40.09 
 
 
478 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  40.48 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  37.22 
 
 
458 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  38.54 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  36.34 
 
 
448 aa  240  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  34.07 
 
 
450 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  33.77 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.67 
 
 
452 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.11 
 
 
456 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  30.96 
 
 
460 aa  190  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  29.86 
 
 
463 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  31.01 
 
 
449 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  29.86 
 
 
465 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  29.86 
 
 
466 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  31.32 
 
 
454 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  29.86 
 
 
466 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  29.41 
 
 
854 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  31.31 
 
 
454 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  28.57 
 
 
868 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  29.28 
 
 
434 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  31.24 
 
 
455 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  30 
 
 
455 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  29.05 
 
 
462 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  31.37 
 
 
456 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.04 
 
 
453 aa  176  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.2 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  28.64 
 
 
863 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.36 
 
 
453 aa  172  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  31.34 
 
 
469 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  29.4 
 
 
446 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  30.59 
 
 
782 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  29.71 
 
 
468 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  31.26 
 
 
459 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  29.67 
 
 
471 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  29.67 
 
 
471 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  28.29 
 
 
458 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  28.33 
 
 
488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  31.16 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  28.85 
 
 
449 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  31.99 
 
 
456 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.28 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  30.94 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  31.93 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  27.9 
 
 
454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  29.84 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  29.57 
 
 
453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  31.99 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  29.59 
 
 
454 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  30.81 
 
 
782 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  28.29 
 
 
430 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  28.24 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  30.17 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.05 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  28.74 
 
 
465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  28.81 
 
 
447 aa  163  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  27.52 
 
 
475 aa  163  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  30 
 
 
434 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  29.98 
 
 
469 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.71 
 
 
430 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  29.88 
 
 
458 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  30.32 
 
 
455 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  29.93 
 
 
830 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  29.6 
 
 
453 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  27.82 
 
 
881 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.72 
 
 
447 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.46 
 
 
442 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  31.5 
 
 
469 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  26.96 
 
 
437 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  29.67 
 
 
479 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  28.57 
 
 
448 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.36 
 
 
437 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  27.74 
 
 
462 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  26.7 
 
 
437 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  27.51 
 
 
465 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  29.4 
 
 
458 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  29.65 
 
 
451 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  28.03 
 
 
465 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  29.63 
 
 
461 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  27.06 
 
 
462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  30.37 
 
 
464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  27.36 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  27.55 
 
 
469 aa  156  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>