More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0388 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  68.87 
 
 		 478 aa  664    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  69.38 
 
 		 492 aa  655    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 		 470 aa  967    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  65.6 
 
 		 470 aa  634  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  63.36 
 
 		 467 aa  608  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.3 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  58.71 
 
 		 471 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  45.28 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  44.42 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  45.63 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  46.41 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  44.96 
 
 		 467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  45.67 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  43.91 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  45.57 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  45.4 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  43.13 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.65 
 
 		 464 aa  361  1e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  37.34 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  37.94 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  34.49 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  33.55 
 
 		 458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  32.76 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  31.48 
 
 		 450 aa  226  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  32.9 
 
 		 480 aa  223  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  28.39 
 
 		 460 aa  183  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.63 
 
 		 456 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  29.27 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  29.27 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.98 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.9 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  27.51 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.95 
 
 		 430 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  28.51 
 
 		 430 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  28.27 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  27.72 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  29.51 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.66 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.14 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  28.21 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.07 
 
 		 430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  28.37 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  27.92 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  28.05 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  28.51 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  27.18 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.95 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  27.54 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  28.66 
 
 		 469 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.37 
 
 		 475 aa  153  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  27.49 
 
 		 462 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  28.64 
 
 		 416 aa  154  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  28.29 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  28.66 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  28.54 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1447  phosphoglucomutase/phosphomannomutase subunit alpha/beta  28.57 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  29.24 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  27.27 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  27.62 
 
 		 461 aa  150  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  28.02 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  28.11 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  27.31 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  27.62 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  26.96 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  28.6 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.6 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  26.96 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  27.78 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  27.67 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  26.32 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  26.02 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  25.46 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0742  phosphoglucosamine mutase  27.48 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  26.61 
 
 		 863 aa  143  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  28.24 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  26.67 
 
 		 782 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  26.5 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  25.49 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  27.39 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  27.31 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  27.23 
 
 		 782 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  25.22 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  25.22 
 
 		 466 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  28.26 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  26.28 
 
 		 444 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  27.17 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.45 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.96 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  26.88 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  26.77 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  26.28 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  27.83 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  26.88 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  27.1 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  26.04 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  27 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  25.43 
 
 		 461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  25.97 
 
 		 854 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  26.45 
 
 		 461 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  26.74 
 
 		 451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>