More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0528 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  100 
 
 
430 aa  885    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  93.49 
 
 
430 aa  838    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  94.88 
 
 
430 aa  846    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  45.18 
 
 
434 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.75 
 
 
433 aa  360  3e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.21 
 
 
419 aa  339  7e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.29 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  42.52 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.04 
 
 
418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.96 
 
 
416 aa  315  7e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.36 
 
 
447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  37.15 
 
 
437 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  37.21 
 
 
437 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  38.11 
 
 
452 aa  296  4e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  36.94 
 
 
446 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  42.2 
 
 
446 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  40.62 
 
 
445 aa  275  8e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.45 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  37.12 
 
 
416 aa  272  7e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  40.05 
 
 
434 aa  272  7e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.7 
 
 
442 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  37.42 
 
 
448 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  36.36 
 
 
450 aa  257  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  36.49 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  37.67 
 
 
480 aa  246  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  33.63 
 
 
452 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  34.74 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.79 
 
 
456 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.44 
 
 
453 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  33.94 
 
 
455 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  32.95 
 
 
458 aa  216  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  33.03 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  31.59 
 
 
448 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  31.66 
 
 
448 aa  210  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.16 
 
 
454 aa  209  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 
449 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  32.82 
 
 
458 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 
448 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 
448 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 
448 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 
448 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 
448 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 
448 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 
448 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  31.07 
 
 
448 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  30.79 
 
 
448 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  31.33 
 
 
454 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  31.64 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  33.94 
 
 
452 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  31.92 
 
 
449 aa  199  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  33.19 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  33.57 
 
 
446 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  30.86 
 
 
447 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  34.32 
 
 
449 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.21 
 
 
453 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  32.87 
 
 
446 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  32.66 
 
 
444 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  29.65 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  30.91 
 
 
445 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  33.64 
 
 
447 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  32.57 
 
 
449 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  31.36 
 
 
449 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  31.45 
 
 
451 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  31.9 
 
 
461 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  29.98 
 
 
444 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  31.43 
 
 
445 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  29.24 
 
 
478 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  34.72 
 
 
456 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  32.07 
 
 
447 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  33.1 
 
 
450 aa  186  8e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  34.95 
 
 
456 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  30.45 
 
 
455 aa  186  9e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  32.24 
 
 
449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  29.3 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  34.72 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  32.52 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  30.02 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  32.8 
 
 
446 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  32.8 
 
 
446 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  32.72 
 
 
448 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  29.63 
 
 
455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  34.52 
 
 
469 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  32.59 
 
 
454 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  32.81 
 
 
452 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.78 
 
 
463 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2740  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.18 
 
 
445 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.93 
 
 
452 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1095  phosphoglucosamine mutase  32.95 
 
 
489 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100565  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  30.97 
 
 
450 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  31.67 
 
 
452 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  32.89 
 
 
459 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  32.43 
 
 
446 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  31.49 
 
 
450 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  32.51 
 
 
445 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  31.35 
 
 
454 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  31.98 
 
 
465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  31.4 
 
 
450 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  32.73 
 
 
445 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  33.03 
 
 
447 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>