More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0372 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
474 aa  969    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  47.25 
 
 
460 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  46.59 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  48.02 
 
 
469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  46.02 
 
 
468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  47.46 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  46.35 
 
 
478 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  46.59 
 
 
469 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  46.8 
 
 
460 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  46.68 
 
 
460 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  44.09 
 
 
488 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  46.93 
 
 
469 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  44.7 
 
 
460 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.82 
 
 
469 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  44.96 
 
 
460 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.48 
 
 
469 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.02 
 
 
463 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  40.52 
 
 
457 aa  352  8.999999999999999e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  41.76 
 
 
463 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.31 
 
 
475 aa  347  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  41.45 
 
 
475 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  40.7 
 
 
475 aa  342  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  43.2 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  41 
 
 
472 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  41.43 
 
 
471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  37.87 
 
 
470 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  39.29 
 
 
471 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.65 
 
 
470 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  39.53 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  37.26 
 
 
467 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  37.1 
 
 
467 aa  317  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  39.28 
 
 
490 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  38.91 
 
 
458 aa  315  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.51 
 
 
466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.67 
 
 
475 aa  309  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.55 
 
 
474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.05 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  36.96 
 
 
472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.6 
 
 
474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.31 
 
 
480 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  38.31 
 
 
480 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.17 
 
 
472 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  38.25 
 
 
478 aa  299  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.15 
 
 
472 aa  299  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.84 
 
 
480 aa  296  8e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  37.58 
 
 
484 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.89 
 
 
472 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  40.09 
 
 
477 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.68 
 
 
467 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  37.15 
 
 
479 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.87 
 
 
472 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  34.59 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  36.86 
 
 
414 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.84 
 
 
487 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  36.42 
 
 
485 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  36.03 
 
 
470 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  35.21 
 
 
486 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  36.62 
 
 
467 aa  277  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  34.45 
 
 
486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  37.04 
 
 
409 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  31.25 
 
 
484 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  34.14 
 
 
473 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  36.03 
 
 
470 aa  273  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  32.34 
 
 
486 aa  272  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  37.61 
 
 
733 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.98 
 
 
487 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  31.04 
 
 
484 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.93 
 
 
470 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  35.82 
 
 
460 aa  268  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.81 
 
 
470 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  31.25 
 
 
484 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.7 
 
 
464 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  37.31 
 
 
482 aa  263  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  37.07 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.2 
 
 
484 aa  252  8.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  32 
 
 
501 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  35.29 
 
 
473 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  32.01 
 
 
465 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  36.34 
 
 
487 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  34.48 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  31.86 
 
 
468 aa  212  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.21 
 
 
471 aa  209  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  32.03 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  32.9 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.57 
 
 
518 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  31.4 
 
 
448 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  30.53 
 
 
458 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  31.43 
 
 
452 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1857  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.4 
 
 
559 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  30.36 
 
 
546 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.65 
 
 
585 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  30.87 
 
 
451 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  30.04 
 
 
451 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  30.04 
 
 
451 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  28.51 
 
 
550 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.75 
 
 
452 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  29.94 
 
 
455 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1841  phosphomannomutase  28.82 
 
 
575 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  28.48 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  29.81 
 
 
448 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>