More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2585 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  83.83 
 
 
470 aa  809    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  85.53 
 
 
470 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  100 
 
 
470 aa  968    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  83.62 
 
 
470 aa  806    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  54.26 
 
 
474 aa  544  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  50.43 
 
 
473 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  41.86 
 
 
733 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  38.22 
 
 
467 aa  343  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.62 
 
 
470 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  36.85 
 
 
478 aa  326  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  37.83 
 
 
486 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  37.25 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  36.6 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  39.02 
 
 
468 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.15 
 
 
469 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  36.72 
 
 
469 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  36.03 
 
 
473 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  35.61 
 
 
467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  36.38 
 
 
488 aa  306  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.21 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.05 
 
 
475 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.71 
 
 
469 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  36.05 
 
 
475 aa  293  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.2 
 
 
472 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.54 
 
 
474 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.54 
 
 
474 aa  292  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.61 
 
 
475 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  34.33 
 
 
472 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.11 
 
 
472 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  35.48 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  36.03 
 
 
474 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.76 
 
 
472 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.98 
 
 
469 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.18 
 
 
467 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.12 
 
 
472 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.03 
 
 
469 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  36.64 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  35.26 
 
 
474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  34.85 
 
 
414 aa  249  8e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  33.41 
 
 
460 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.62 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  34.94 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  33.41 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.4 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  32.47 
 
 
460 aa  239  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  31.79 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  32.23 
 
 
458 aa  233  6e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  32.47 
 
 
460 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  31.4 
 
 
460 aa  232  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  32.63 
 
 
467 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.23 
 
 
484 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  30.8 
 
 
501 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  32.21 
 
 
482 aa  226  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  32.37 
 
 
470 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  32.47 
 
 
503 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.79 
 
 
475 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  31.03 
 
 
472 aa  224  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  30.04 
 
 
460 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  29.9 
 
 
484 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  32.28 
 
 
490 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  29.9 
 
 
484 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.04 
 
 
463 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  30.43 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.52 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  29.52 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  29.63 
 
 
486 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  29.65 
 
 
486 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  29.81 
 
 
484 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  30.25 
 
 
479 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  29.44 
 
 
486 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.67 
 
 
473 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  30.95 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.04 
 
 
480 aa  201  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.08 
 
 
471 aa  199  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  28.45 
 
 
484 aa  196  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  28.75 
 
 
477 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  29.31 
 
 
478 aa  196  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.3 
 
 
487 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.31 
 
 
487 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  28.6 
 
 
485 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  29.11 
 
 
487 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.88 
 
 
518 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  29.42 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  27.84 
 
 
480 aa  171  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  28.43 
 
 
547 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.38 
 
 
576 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1985  phosphoglucomutase  28.41 
 
 
568 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  29.61 
 
 
448 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  28.85 
 
 
547 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0573  phosphomannomutase  30.52 
 
 
474 aa  160  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.660588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  27.81 
 
 
452 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  27.75 
 
 
458 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  27.97 
 
 
460 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  27.93 
 
 
559 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.25 
 
 
574 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  29.04 
 
 
545 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  28.83 
 
 
548 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  27.54 
 
 
548 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  27.13 
 
 
547 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  27.67 
 
 
450 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>