More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1292 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 		 471 aa  963    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  38.92 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.91 
 
 		 469 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  32.5 
 
 		 488 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.19 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  33.48 
 
 		 475 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  33.48 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  31.33 
 
 		 478 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  30.28 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  32.24 
 
 		 471 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.28 
 
 		 469 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.59 
 
 		 466 aa  219  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  29.64 
 
 		 468 aa  217  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  28.85 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.58 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  32.37 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  29.79 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.28 
 
 		 469 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  31.21 
 
 		 474 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.13 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  28.88 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.77 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  26.67 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  30.17 
 
 		 460 aa  204  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  29.01 
 
 		 470 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.95 
 
 		 480 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  30.95 
 
 		 480 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.76 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  27.83 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  30.11 
 
 		 467 aa  199  7.999999999999999e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  31.3 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.11 
 
 		 467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  29.74 
 
 		 460 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  29.44 
 
 		 460 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  30.23 
 
 		 490 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  27.08 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  30.26 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  28.33 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  30.72 
 
 		 472 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  29.53 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  27.56 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.96 
 
 		 487 aa  189  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  29.24 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.12 
 
 		 487 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  28.6 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.23 
 
 		 460 aa  186  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  30.61 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  27.99 
 
 		 470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  31.95 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  25.87 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.87 
 
 		 474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  26.74 
 
 		 467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.66 
 
 		 474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.24 
 
 		 472 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  26.85 
 
 		 486 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  26.88 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  28.63 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  28.57 
 
 		 460 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  24.68 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  28.75 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  27.08 
 
 		 474 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  29.57 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  30.72 
 
 		 473 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.45 
 
 		 472 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  24.79 
 
 		 484 aa  176  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  24.69 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.75 
 
 		 472 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  27.62 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.57 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.24 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.26 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  30.26 
 
 		 733 aa  166  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  24.31 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  27.43 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  26.52 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  28.84 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  28.02 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.9 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  27.31 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  27.52 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  22.96 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.32 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  24.31 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.65 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  22.64 
 
 		 409 aa  130  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  27.59 
 
 		 468 aa  130  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  24.46 
 
 		 448 aa  126  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  24.41 
 
 		 547 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  26.24 
 
 		 548 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  28.12 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  24.22 
 
 		 548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  23.92 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  24.09 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  25.1 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  27.62 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  24.9 
 
 		 548 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  24.02 
 
 		 546 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  24.02 
 
 		 546 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  24.9 
 
 		 548 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  25.05 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>