More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3964 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  69.51 
 
 		 469 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  71.86 
 
 		 469 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  66.95 
 
 		 468 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 		 469 aa  951    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  94.88 
 
 		 469 aa  863    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  70.36 
 
 		 478 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  75.05 
 
 		 469 aa  724    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  48.65 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  47.86 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  47.82 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  46.19 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  41.44 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  41.61 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.47 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  43.01 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  42.2 
 
 		 470 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  44.33 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  43.01 
 
 		 474 aa  360  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  43.23 
 
 		 471 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.91 
 
 		 466 aa  356  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  42.64 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  38.94 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.41 
 
 		 480 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  41.41 
 
 		 480 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.97 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.96 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  41.79 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.74 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  42.23 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  40.92 
 
 		 467 aa  345  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  41.79 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  41.41 
 
 		 479 aa  342  9e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  40.94 
 
 		 460 aa  342  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.54 
 
 		 475 aa  340  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  42.24 
 
 		 490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  41.58 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.94 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  43.66 
 
 		 477 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  42.22 
 
 		 460 aa  336  7e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  38.68 
 
 		 472 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  41.42 
 
 		 484 aa  329  8e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  37.82 
 
 		 473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.74 
 
 		 472 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.98 
 
 		 480 aa  326  6e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  41.7 
 
 		 478 aa  325  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  38.79 
 
 		 475 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  39.86 
 
 		 414 aa  319  7e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.25 
 
 		 472 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  40.59 
 
 		 409 aa  317  4e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  38.36 
 
 		 475 aa  316  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.05 
 
 		 472 aa  316  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.75 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  35.24 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.89 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  37.89 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.62 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  35.41 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  38.28 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  36.14 
 
 		 474 aa  299  8e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  37.68 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.13 
 
 		 487 aa  297  3e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.98 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  37.02 
 
 		 733 aa  295  8e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.12 
 
 		 470 aa  295  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.13 
 
 		 487 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  38.55 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  37.27 
 
 		 485 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  38.8 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  36.23 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  34.22 
 
 		 486 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  37.6 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  34.1 
 
 		 484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  33.89 
 
 		 484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  39.13 
 
 		 487 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.84 
 
 		 484 aa  270  5e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  33.19 
 
 		 484 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.61 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  31.21 
 
 		 501 aa  256  7e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  36.53 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  33.62 
 
 		 465 aa  247  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.28 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  34.25 
 
 		 468 aa  216  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.13 
 
 		 518 aa  207  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  29.72 
 
 		 553 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  28.24 
 
 		 547 aa  176  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  31.23 
 
 		 549 aa  176  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  31.43 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  30.56 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  30.44 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2127  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.94 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.194048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1841  phosphomannomutase  29.27 
 
 		 575 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  30.06 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  30.12 
 
 		 546 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0873  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.13 
 
 		 564 aa  169  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1066  phosphoglucomutase  30.16 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00652897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  29.22 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  30.31 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  29.74 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  29.53 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  29.44 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>