More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1298 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5639  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  58.63 
 
 
545 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830487  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  58.61 
 
 
545 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  58.97 
 
 
561 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  56.39 
 
 
550 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000239704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  58.79 
 
 
551 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  60.48 
 
 
545 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  56.02 
 
 
550 aa  643    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
548 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  59.71 
 
 
549 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  58.78 
 
 
547 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  58.79 
 
 
548 aa  647    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  56.35 
 
 
550 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  100 
 
 
547 aa  1123    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  56.57 
 
 
550 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  0.00000000164585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3191  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  58.71 
 
 
561 aa  640    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0301219 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  58.5 
 
 
547 aa  665    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  56.2 
 
 
550 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000344179  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  56.2 
 
 
550 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02553  phosphoglucomutase  56.47 
 
 
550 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  58.01 
 
 
550 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  60 
 
 
546 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  57.83 
 
 
550 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  58.61 
 
 
545 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1985  phosphoglucomutase  55.87 
 
 
568 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  57.46 
 
 
550 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  58.64 
 
 
547 aa  648    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  59.16 
 
 
549 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  56.1 
 
 
550 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  56.28 
 
 
550 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  58.58 
 
 
552 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  56.1 
 
 
550 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  58.9 
 
 
547 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  59.93 
 
 
545 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1330  phosphoglucomutase  58.06 
 
 
546 aa  637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66611  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  60.07 
 
 
550 aa  668    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  57.84 
 
 
563 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  59.96 
 
 
548 aa  643    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  58.06 
 
 
545 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  56.57 
 
 
550 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  56.37 
 
 
550 aa  634  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  58.23 
 
 
546 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  58.24 
 
 
551 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  57.64 
 
 
553 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5043  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  57.8 
 
 
544 aa  630  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  57.12 
 
 
548 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1707  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
553 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2159  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
547 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260766  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  56.04 
 
 
547 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  58.78 
 
 
547 aa  630  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1728  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
553 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20751  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1775  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
553 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  56.3 
 
 
546 aa  625  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  54.7 
 
 
548 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  56.33 
 
 
549 aa  628  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1581  phosphoglucomutase  58.5 
 
 
553 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  56.75 
 
 
548 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  55.6 
 
 
559 aa  624  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  57.9 
 
 
547 aa  624  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  57.51 
 
 
545 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  56.59 
 
 
547 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0168  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  57.66 
 
 
556 aa  618  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.839456  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  57.75 
 
 
553 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  58.53 
 
 
546 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  57.61 
 
 
550 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2029  phosphoglucomutase  58.2 
 
 
546 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.744455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  56.23 
 
 
547 aa  616  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  56.23 
 
 
547 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  55.86 
 
 
547 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  55.86 
 
 
548 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01520  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  57.22 
 
 
556 aa  613  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  56.04 
 
 
547 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  56.04 
 
 
547 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  56.04 
 
 
547 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  54.84 
 
 
547 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  56.17 
 
 
553 aa  614  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0258  phosphoglucomutase  56.41 
 
 
551 aa  609  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0336385  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  56.62 
 
 
551 aa  610  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  56.04 
 
 
547 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  57.8 
 
 
549 aa  611  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  55.68 
 
 
548 aa  608  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  54.84 
 
 
548 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1849  phosphoglucomutase  57.27 
 
 
546 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  56.22 
 
 
546 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1203  phosphoglucomutase  55.6 
 
 
546 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  decreased coverage  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  56.15 
 
 
550 aa  606  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2943  phosphoglucomutase  56.12 
 
 
550 aa  608  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1934  phosphoglucomutase  57.27 
 
 
546 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  56.83 
 
 
557 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01060  phosphoglucomutase  56.55 
 
 
572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2275  phosphoglucomutase  54.99 
 
 
550 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00864716  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  56.03 
 
 
546 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  55.78 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13085  phosphoglucomutase  57.48 
 
 
547 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.794041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  54.13 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  57.27 
 
 
564 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0467  phosphoglucomutase  53.93 
 
 
553 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2949  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  55.41 
 
 
546 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  55.23 
 
 
546 aa  597  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000485556  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0716  phosphoglucomutase  55.41 
 
 
546 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000022067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0735  phosphoglucomutase  55.41 
 
 
546 aa  597  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>