More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2670 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00645  phosphoglucomutase  59.7 
 
 
546 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000381568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2949  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  59.89 
 
 
546 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  61.72 
 
 
553 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  62.45 
 
 
547 aa  705    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  60.29 
 
 
557 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0819  phosphoglucomutase  60.07 
 
 
546 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00834178  normal  0.142423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  82.23 
 
 
545 aa  929    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  62.31 
 
 
546 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  58.96 
 
 
547 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2968  phosphoglucomutase  59.89 
 
 
546 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00229066  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5639  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  63.55 
 
 
545 aa  685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830487  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  62.69 
 
 
546 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  85.4 
 
 
548 aa  982    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  60.15 
 
 
547 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0783  phosphoglucomutase  59.52 
 
 
546 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00118232  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  58.04 
 
 
548 aa  638    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0735  phosphoglucomutase  59.89 
 
 
546 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3191  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  60.11 
 
 
561 aa  649    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0301219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  85.9 
 
 
548 aa  985    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  61.25 
 
 
545 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  64.17 
 
 
553 aa  719    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1934  phosphoglucomutase  63.03 
 
 
546 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  60.07 
 
 
546 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  58.35 
 
 
547 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  100 
 
 
548 aa  1126    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  59.89 
 
 
549 aa  665    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  64.97 
 
 
550 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0562  phosphoglucomutase  59.89 
 
 
546 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  59.89 
 
 
549 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  63.17 
 
 
547 aa  705    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2943  phosphoglucomutase  72.06 
 
 
550 aa  805    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  59.78 
 
 
547 aa  645    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  59.71 
 
 
547 aa  679    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0716  phosphoglucomutase  59.52 
 
 
546 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000022067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  65.14 
 
 
548 aa  740    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0168  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  61.59 
 
 
556 aa  651    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.839456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01520  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  60.43 
 
 
556 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0467  phosphoglucomutase  65.2 
 
 
553 aa  758    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  60.89 
 
 
547 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2029  phosphoglucomutase  63.22 
 
 
546 aa  678    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.744455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1231  phosphoglucomutase  61.13 
 
 
566 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  62.31 
 
 
550 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  62.41 
 
 
552 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  70.09 
 
 
559 aa  813    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  60.63 
 
 
546 aa  676    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  65.11 
 
 
550 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  62.84 
 
 
551 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1518  phosphoglucomutase  68.32 
 
 
552 aa  767    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186738  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0545  phosphoglucomutase  70.07 
 
 
561 aa  807    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  61.36 
 
 
550 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  64.37 
 
 
550 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0855  phosphoglucomutase  60.07 
 
 
546 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0156964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  60.07 
 
 
546 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  60.33 
 
 
546 aa  635    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  62.94 
 
 
547 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1728  phosphoglucomutase  61.26 
 
 
553 aa  668    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1849  phosphoglucomutase  63.4 
 
 
546 aa  679    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13085  phosphoglucomutase  61.93 
 
 
547 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.794041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  82.23 
 
 
545 aa  928    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  81.68 
 
 
545 aa  927    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  61.24 
 
 
548 aa  671    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  54.83 
 
 
550 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  59.78 
 
 
547 aa  654    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1203  phosphoglucomutase  60.37 
 
 
546 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  decreased coverage  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2159  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
547 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260766  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5250  phosphoglucomutase  61.64 
 
 
550 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254394  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  60.51 
 
 
547 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  61.47 
 
 
549 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  60.26 
 
 
550 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  60.44 
 
 
548 aa  662    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  62.87 
 
 
550 aa  715    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  62.09 
 
 
564 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3003  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  62.48 
 
 
546 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1775  phosphoglucomutase  61.26 
 
 
553 aa  668    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346978  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  59.52 
 
 
550 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  61.24 
 
 
547 aa  665    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  61.62 
 
 
563 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  69.8 
 
 
553 aa  785    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  60.07 
 
 
546 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000485556  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  81.68 
 
 
545 aa  900    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  62.64 
 
 
561 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  60.44 
 
 
551 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5043  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  64.14 
 
 
544 aa  693    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  58.96 
 
 
547 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  62.11 
 
 
547 aa  682    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1707  phosphoglucomutase  61.26 
 
 
553 aa  668    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  57.3 
 
 
547 aa  638    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  59.15 
 
 
547 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  63.9 
 
 
545 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00636  hypothetical protein  59.7 
 
 
546 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000314178  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  54.83 
 
 
550 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  54.83 
 
 
550 aa  634  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0806  phosphoglucomutase  59.89 
 
 
546 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000341822  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  58.12 
 
 
548 aa  628  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1695  phosphoglucomutase  57.51 
 
 
551 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  57.93 
 
 
548 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  54.28 
 
 
550 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1330  phosphoglucomutase  57.61 
 
 
546 aa  625  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66611  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  56.56 
 
 
549 aa  628  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  57.01 
 
 
548 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>