More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4438 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  59.78 
 
 		 547 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  60.95 
 
 		 545 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5639  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  73.68 
 
 		 545 aa  797    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830487  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3191  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  72.27 
 
 		 561 aa  776    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0301219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5043  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  77.64 
 
 		 544 aa  848    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  60.81 
 
 		 548 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  60.15 
 
 		 547 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  61.13 
 
 		 545 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  64.71 
 
 		 547 aa  683    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  60.44 
 
 		 548 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  60.44 
 
 		 545 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1755  phosphoglucomutase  59.43 
 
 		 558 aa  654    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1707  phosphoglucomutase  72.43 
 
 		 553 aa  782    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  62.09 
 
 		 548 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01060  phosphoglucomutase  68.09 
 
 		 572 aa  736    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  64.78 
 
 		 550 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  61.24 
 
 		 549 aa  644    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3003  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  69.69 
 
 		 546 aa  693    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  62.61 
 
 		 553 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  59.52 
 
 		 547 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  69.58 
 
 		 550 aa  757    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1849  phosphoglucomutase  64.43 
 
 		 546 aa  654    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1934  phosphoglucomutase  64.25 
 
 		 546 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2029  phosphoglucomutase  64.43 
 
 		 546 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.744455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1231  phosphoglucomutase  64.48 
 
 		 566 aa  684    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  63 
 
 		 550 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  59.96 
 
 		 547 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  78.3 
 
 		 551 aa  865    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  59.89 
 
 		 559 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  61.21 
 
 		 546 aa  643    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  61.72 
 
 		 550 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  65.2 
 
 		 552 aa  702    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  69.8 
 
 		 547 aa  737    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  62.45 
 
 		 550 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0168  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  73.24 
 
 		 556 aa  791    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.839456  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  61.76 
 
 		 547 aa  635    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  61.17 
 
 		 545 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1728  phosphoglucomutase  72.43 
 
 		 553 aa  782    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  63.88 
 
 		 547 aa  668    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  71.48 
 
 		 549 aa  772    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0373  phosphoglucomutase  73.74 
 
 		 559 aa  768    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.634415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  66.06 
 
 		 545 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01520  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  72.07 
 
 		 556 aa  773    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  72.78 
 
 		 546 aa  783    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  59.89 
 
 		 548 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  59.96 
 
 		 547 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  60.15 
 
 		 547 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5250  phosphoglucomutase  65.81 
 
 		 550 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254394  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  72.38 
 
 		 561 aa  787    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  70.07 
 
 		 549 aa  756    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  61.44 
 
 		 550 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  60.5 
 
 		 557 aa  657    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  70.78 
 
 		 557 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  60.81 
 
 		 550 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  61.99 
 
 		 546 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  100 
 
 		 564 aa  1132    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  72.73 
 
 		 546 aa  750    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1775  phosphoglucomutase  72.43 
 
 		 553 aa  782    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  61.43 
 
 		 550 aa  691    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  72.07 
 
 		 563 aa  786    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13085  phosphoglucomutase  72.73 
 
 		 547 aa  764    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.794041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  63.05 
 
 		 553 aa  675    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0258  phosphoglucomutase  68.93 
 
 		 551 aa  743    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0336385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  59.71 
 
 		 548 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  63.79 
 
 		 548 aa  673    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  72.39 
 
 		 551 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  57.22 
 
 		 548 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  58.76 
 
 		 546 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  58.73 
 
 		 547 aa  634  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  59.71 
 
 		 547 aa  634  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  56.8 
 
 		 548 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  59.41 
 
 		 547 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  57.04 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1203  phosphoglucomutase  58.87 
 
 		 546 aa  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  decreased coverage  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  59.41 
 
 		 547 aa  628  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  58.76 
 
 		 546 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  60.07 
 
 		 553 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2943  phosphoglucomutase  60.33 
 
 		 550 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  56.67 
 
 		 548 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1695  phosphoglucomutase  58.03 
 
 		 551 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  60.89 
 
 		 551 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0467  phosphoglucomutase  58.79 
 
 		 553 aa  621  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  58.58 
 
 		 547 aa  618  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00645  phosphoglucomutase  58.39 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000381568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2949  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  58.39 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0819  phosphoglucomutase  58.76 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00834178  normal  0.142423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0855  phosphoglucomutase  58.76 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0156964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2968  phosphoglucomutase  58.39 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00229066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0783  phosphoglucomutase  58.39 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00118232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0562  phosphoglucomutase  58.39 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0735  phosphoglucomutase  58.39 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00636  hypothetical protein  58.39 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000314178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  58.21 
 
 		 546 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000485556  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0716  phosphoglucomutase  58.21 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000022067  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  54.64 
 
 		 550 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0806  phosphoglucomutase  58.58 
 
 		 546 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000341822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1518  phosphoglucomutase  60.22 
 
 		 552 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0545  phosphoglucomutase  58.61 
 
 		 561 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  56.25 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  60.07 
 
 		 545 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>