More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4511 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  56.75 
 
 
546 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  98.91 
 
 
550 aa  1121    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1581  phosphoglucomutase  60.65 
 
 
553 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  90.55 
 
 
550 aa  1031    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  70.67 
 
 
548 aa  826    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  58.87 
 
 
545 aa  668    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1922  phosphoglucomutase  67.91 
 
 
559 aa  785    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  58.35 
 
 
550 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  98.91 
 
 
550 aa  1122    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  0.00000000164585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
547 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  56.75 
 
 
546 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  61.02 
 
 
547 aa  689    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2332  phosphoglucomutase  70.76 
 
 
551 aa  809    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90326  hitchhiker  0.000453174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2275  phosphoglucomutase  71.12 
 
 
550 aa  809    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00864716  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02553  phosphoglucomutase  57.79 
 
 
550 aa  663    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  59.93 
 
 
548 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  58.36 
 
 
548 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2159  phosphoglucomutase  60.25 
 
 
547 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260766  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  56.2 
 
 
547 aa  638    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  94.73 
 
 
550 aa  1081    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  60.55 
 
 
546 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  56.32 
 
 
550 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1985  phosphoglucomutase  70.14 
 
 
568 aa  845    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0855  phosphoglucomutase  56.75 
 
 
546 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0156964  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  56.23 
 
 
549 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  56.36 
 
 
549 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  89.82 
 
 
550 aa  1029    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  90 
 
 
550 aa  1032    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  74.86 
 
 
547 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  89.82 
 
 
550 aa  1028    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1706  phosphoglucomutase  70 
 
 
560 aa  793    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  58.03 
 
 
550 aa  667    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  55.33 
 
 
551 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  58.36 
 
 
548 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  58.65 
 
 
548 aa  651    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  56.08 
 
 
561 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  100 
 
 
550 aa  1132    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  100 
 
 
550 aa  1132    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000344179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  98.55 
 
 
550 aa  1115    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000239704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00645  phosphoglucomutase  56.39 
 
 
546 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000381568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2949  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  56.39 
 
 
546 aa  633  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0168  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  54.95 
 
 
556 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.839456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  57.12 
 
 
547 aa  633  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  57.19 
 
 
547 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0819  phosphoglucomutase  56.75 
 
 
546 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00834178  normal  0.142423 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00636  hypothetical protein  56.39 
 
 
546 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000314178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  55.96 
 
 
553 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0783  phosphoglucomutase  56.2 
 
 
546 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00118232  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  55.92 
 
 
547 aa  633  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  55.37 
 
 
547 aa  631  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0735  phosphoglucomutase  56.39 
 
 
546 aa  633  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  55.49 
 
 
547 aa  631  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0562  phosphoglucomutase  56.39 
 
 
546 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0716  phosphoglucomutase  56.02 
 
 
546 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000022067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2968  phosphoglucomutase  56.39 
 
 
546 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00229066  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  56.39 
 
 
546 aa  634  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000485556  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1203  phosphoglucomutase  56.02 
 
 
546 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  decreased coverage  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0806  phosphoglucomutase  56.57 
 
 
546 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000341822  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5639  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  54.03 
 
 
545 aa  628  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830487  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  54.74 
 
 
552 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3191  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  55.02 
 
 
561 aa  625  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0301219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  55.58 
 
 
550 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  53.87 
 
 
563 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  55.66 
 
 
547 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  55.47 
 
 
547 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  55.47 
 
 
547 aa  624  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  54.13 
 
 
550 aa  624  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  54.93 
 
 
548 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  55.47 
 
 
547 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  53.86 
 
 
550 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01520  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  54.17 
 
 
556 aa  619  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  55.92 
 
 
547 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  55.6 
 
 
545 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1330  phosphoglucomutase  54.2 
 
 
546 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66611  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  55.09 
 
 
548 aa  621  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  53.64 
 
 
550 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  54.21 
 
 
546 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  54.84 
 
 
551 aa  621  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  54.2 
 
 
545 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1728  phosphoglucomutase  54.55 
 
 
553 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  54.48 
 
 
547 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5043  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  54.88 
 
 
544 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1775  phosphoglucomutase  54.55 
 
 
553 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346978  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1707  phosphoglucomutase  54.55 
 
 
553 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  53.01 
 
 
548 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  53.83 
 
 
545 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  54.1 
 
 
548 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  54.46 
 
 
550 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  54.1 
 
 
547 aa  614  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  54.2 
 
 
545 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13085  phosphoglucomutase  56.16 
 
 
547 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.794041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  53.53 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  54.36 
 
 
551 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  52.64 
 
 
548 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  53.11 
 
 
546 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  54.83 
 
 
553 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  54.41 
 
 
546 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  52.92 
 
 
559 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  54.28 
 
 
564 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  54.01 
 
 
545 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>