More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0352 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
475 aa  954    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  55.91 
 
 
463 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  55.7 
 
 
473 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  41.7 
 
 
463 aa  346  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  44.4 
 
 
488 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  45.23 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  45.3 
 
 
469 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  39.75 
 
 
480 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.75 
 
 
480 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  43.8 
 
 
468 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  42.68 
 
 
478 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.19 
 
 
469 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  38.38 
 
 
457 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  39.79 
 
 
479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.54 
 
 
469 aa  319  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  42.53 
 
 
477 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  41.08 
 
 
471 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  41.08 
 
 
490 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.74 
 
 
469 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.29 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  41.25 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  39.67 
 
 
474 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.34 
 
 
480 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  39.62 
 
 
460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  39.75 
 
 
478 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  39.62 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  41.37 
 
 
467 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  41.25 
 
 
472 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  39.58 
 
 
475 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.23 
 
 
472 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  39.87 
 
 
475 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  35.93 
 
 
470 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  39.49 
 
 
460 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  40.04 
 
 
474 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  36.83 
 
 
458 aa  295  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.03 
 
 
475 aa  293  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.08 
 
 
472 aa  293  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  39.03 
 
 
460 aa  292  7e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.58 
 
 
472 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.5 
 
 
460 aa  290  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  40.04 
 
 
486 aa  290  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  37.71 
 
 
472 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.88 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.98 
 
 
474 aa  282  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  35.86 
 
 
467 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  38.14 
 
 
460 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.77 
 
 
474 aa  279  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  37.58 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  35.85 
 
 
486 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  35.85 
 
 
486 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.66 
 
 
472 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  38 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  37.27 
 
 
485 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.44 
 
 
467 aa  262  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.39 
 
 
487 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  34.96 
 
 
473 aa  259  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.87 
 
 
487 aa  257  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  38.16 
 
 
487 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  37.42 
 
 
470 aa  249  8e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  33.62 
 
 
467 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  30.5 
 
 
486 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  32.08 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  36.21 
 
 
460 aa  234  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  35.07 
 
 
414 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.74 
 
 
464 aa  226  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  30.32 
 
 
484 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  29.03 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  28.81 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  34.29 
 
 
409 aa  221  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  37.19 
 
 
482 aa  219  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  31.79 
 
 
470 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.49 
 
 
484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  31.17 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  34.73 
 
 
473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  32.01 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  30.18 
 
 
501 aa  209  8e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  32.38 
 
 
470 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  32.28 
 
 
465 aa  209  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.77 
 
 
471 aa  207  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  33.9 
 
 
733 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  32.55 
 
 
503 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  34.85 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0159  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.87 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.309017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0157  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.87 
 
 
471 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.48 
 
 
518 aa  161  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  29.79 
 
 
458 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1857  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.43 
 
 
559 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.09 
 
 
456 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  30.82 
 
 
480 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  30.04 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  30.67 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  25.63 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  29.39 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  28.63 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4380  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  31.66 
 
 
539 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.973187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  30.25 
 
 
551 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  28.22 
 
 
557 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  31.01 
 
 
549 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  29.16 
 
 
546 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  28.6 
 
 
548 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>