More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1486 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  100 
 
 
457 aa  925    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  47.93 
 
 
458 aa  427  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  45.69 
 
 
463 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  40.8 
 
 
488 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  39.57 
 
 
469 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  38.38 
 
 
478 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.94 
 
 
469 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  40.52 
 
 
474 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  38.22 
 
 
468 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.77 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.25 
 
 
469 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  41.01 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  36.42 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.94 
 
 
469 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.72 
 
 
469 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.38 
 
 
475 aa  324  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.18 
 
 
475 aa  318  9e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  37.92 
 
 
471 aa  318  9e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  40.98 
 
 
474 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.53 
 
 
466 aa  312  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.52 
 
 
473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  37.75 
 
 
475 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  37.79 
 
 
486 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.83 
 
 
460 aa  309  8e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  38.04 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  38.58 
 
 
470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.34 
 
 
467 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.62 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  39.87 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  37.83 
 
 
460 aa  302  9e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  37.86 
 
 
475 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  37.82 
 
 
479 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  37.39 
 
 
460 aa  299  6e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  38.31 
 
 
471 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  37.61 
 
 
460 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.96 
 
 
472 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  39.1 
 
 
477 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  37.31 
 
 
486 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  37.71 
 
 
478 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.17 
 
 
487 aa  286  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  36.54 
 
 
490 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.81 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.17 
 
 
480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  36.17 
 
 
480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  37.53 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  34.6 
 
 
472 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  36.78 
 
 
460 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  36.5 
 
 
460 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.05 
 
 
487 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  35.22 
 
 
460 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.33 
 
 
474 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.12 
 
 
474 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  34.89 
 
 
485 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.79 
 
 
472 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.47 
 
 
480 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  36.84 
 
 
484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  35.68 
 
 
472 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  34.54 
 
 
484 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  35.52 
 
 
484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.05 
 
 
472 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  34.66 
 
 
486 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  31.57 
 
 
473 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  35.38 
 
 
484 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  35.04 
 
 
414 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  33.99 
 
 
409 aa  253  6e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  34.69 
 
 
470 aa  250  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  31.86 
 
 
482 aa  250  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  35.88 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.47 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  32.48 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  32.41 
 
 
470 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  32.83 
 
 
473 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  31.68 
 
 
474 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  32.62 
 
 
470 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.76 
 
 
464 aa  236  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  32.2 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  31.79 
 
 
470 aa  230  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  28.81 
 
 
501 aa  226  8e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  29.92 
 
 
503 aa  220  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  31.53 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  30.04 
 
 
733 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.83 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2334  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  31.94 
 
 
577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  32.4 
 
 
460 aa  176  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.66 
 
 
518 aa  176  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5884  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.47 
 
 
574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.830528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  32.37 
 
 
480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  29.44 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  29.54 
 
 
449 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  33.11 
 
 
450 aa  172  7.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  29.44 
 
 
458 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0573  phosphomannomutase  30.62 
 
 
474 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.660588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0159  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.44 
 
 
471 aa  171  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.309017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0157  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.44 
 
 
471 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  30.89 
 
 
448 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1998  phosphohexose mutase family protein  28.04 
 
 
587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3113  phosphoglucomutase  28.4 
 
 
543 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.505791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2887  phosphoglucomutase  28.4 
 
 
543 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3010  phosphoglucomutase  28.4 
 
 
543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0486  phosphomannomutase  30.95 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.499643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>