More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3100 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  100 
 
 
486 aa  995    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  63.56 
 
 
470 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  56.39 
 
 
467 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  54.68 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  52.28 
 
 
466 aa  501  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  49.48 
 
 
470 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  45.76 
 
 
475 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  46.92 
 
 
475 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  45.23 
 
 
467 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  43.61 
 
 
473 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.16 
 
 
472 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.37 
 
 
474 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.13 
 
 
472 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.16 
 
 
474 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.28 
 
 
472 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  42.86 
 
 
472 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.16 
 
 
469 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  42.92 
 
 
469 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  41.85 
 
 
468 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  43.23 
 
 
469 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.24 
 
 
467 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.85 
 
 
472 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  42.46 
 
 
471 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  41.84 
 
 
488 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  40.59 
 
 
478 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.01 
 
 
469 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  42.04 
 
 
463 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.68 
 
 
469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.38 
 
 
475 aa  356  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  40.94 
 
 
474 aa  349  8e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  41.49 
 
 
473 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  39.12 
 
 
474 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  39.53 
 
 
474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  38.76 
 
 
470 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  37.79 
 
 
457 aa  326  6e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  39.18 
 
 
470 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  38.97 
 
 
470 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  38.11 
 
 
733 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  37.83 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  37.08 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  36.07 
 
 
479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  37.2 
 
 
458 aa  302  7.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.04 
 
 
475 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.15 
 
 
484 aa  299  8e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  36.75 
 
 
460 aa  294  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  35.09 
 
 
480 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.09 
 
 
480 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  36.11 
 
 
460 aa  292  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.46 
 
 
464 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  35.26 
 
 
501 aa  288  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  35.22 
 
 
482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.32 
 
 
460 aa  286  8e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  36.71 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  37.55 
 
 
472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.34 
 
 
463 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  38.02 
 
 
490 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  35.7 
 
 
477 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  36.59 
 
 
409 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  35.32 
 
 
460 aa  279  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  36.21 
 
 
414 aa  276  8e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  36.29 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  34.19 
 
 
460 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.45 
 
 
478 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  33.97 
 
 
460 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  35.23 
 
 
503 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  33.9 
 
 
460 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  35.61 
 
 
467 aa  262  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.26 
 
 
480 aa  262  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  36.15 
 
 
468 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  33.54 
 
 
484 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  34.66 
 
 
485 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.06 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.4 
 
 
487 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  33.96 
 
 
470 aa  242  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.71 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  35.54 
 
 
487 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  30.6 
 
 
486 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  32.85 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  30.45 
 
 
484 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  30.45 
 
 
484 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  32.81 
 
 
548 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  33.01 
 
 
548 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  30.98 
 
 
484 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.45 
 
 
518 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  30.21 
 
 
545 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  30.36 
 
 
545 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  31.55 
 
 
548 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  30.02 
 
 
545 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  31.14 
 
 
545 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  28.79 
 
 
550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  32.05 
 
 
546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  30.78 
 
 
548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  30.71 
 
 
545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  29.59 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  30.69 
 
 
545 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  30.37 
 
 
549 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.53 
 
 
471 aa  196  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  30.46 
 
 
547 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  29.59 
 
 
553 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  30.94 
 
 
547 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>