More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0990 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  85.38 
 
 
472 aa  837    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  78.13 
 
 
472 aa  773    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
472 aa  957    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  75.42 
 
 
474 aa  742    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  70.55 
 
 
472 aa  703    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  75 
 
 
474 aa  739    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  70.43 
 
 
472 aa  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  63.06 
 
 
473 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  49.26 
 
 
467 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.22 
 
 
470 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  41.33 
 
 
470 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  44.16 
 
 
486 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  43.07 
 
 
467 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  43.64 
 
 
467 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  43.25 
 
 
475 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  43.13 
 
 
475 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  43.1 
 
 
471 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.83 
 
 
466 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  40.34 
 
 
488 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  41.21 
 
 
463 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.07 
 
 
469 aa  329  7e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  37.63 
 
 
478 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  39.69 
 
 
468 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.07 
 
 
469 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  39.11 
 
 
469 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  40.04 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.97 
 
 
475 aa  310  4e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.38 
 
 
484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.42 
 
 
464 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.25 
 
 
469 aa  299  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.25 
 
 
469 aa  299  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.23 
 
 
475 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  38.1 
 
 
503 aa  292  9e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  35.87 
 
 
474 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  37.28 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  39.11 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  36.7 
 
 
460 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  34.86 
 
 
474 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  34.75 
 
 
501 aa  277  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  35.79 
 
 
457 aa  276  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.53 
 
 
463 aa  276  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  36.56 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  36.21 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  37.23 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  38.72 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.98 
 
 
460 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  35.61 
 
 
460 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  35.32 
 
 
460 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  34.53 
 
 
733 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  33.12 
 
 
470 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  33.33 
 
 
470 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  33.54 
 
 
470 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  33.2 
 
 
479 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  36.21 
 
 
477 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  33.89 
 
 
472 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  36.62 
 
 
473 aa  260  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.85 
 
 
478 aa  259  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  33.47 
 
 
470 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.97 
 
 
480 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  32.91 
 
 
458 aa  257  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  32.64 
 
 
486 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  33.96 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  34.46 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  32.44 
 
 
486 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  32.24 
 
 
480 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.24 
 
 
480 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.61 
 
 
473 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  35.28 
 
 
468 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  35.78 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  35.78 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  32.24 
 
 
484 aa  236  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.17 
 
 
487 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.65 
 
 
487 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  30.42 
 
 
485 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  31.75 
 
 
486 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.2 
 
 
518 aa  224  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  32.57 
 
 
470 aa  223  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  32.16 
 
 
487 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  31.02 
 
 
484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  31.13 
 
 
484 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  30.72 
 
 
484 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  34.22 
 
 
551 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  33.62 
 
 
465 aa  203  5e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  31.51 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  31.31 
 
 
548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  33.67 
 
 
549 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  31.37 
 
 
550 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  30.45 
 
 
550 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  30.26 
 
 
550 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  0.00000000164585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  30.26 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000344179  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  30.26 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  30.26 
 
 
550 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000239704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  31.37 
 
 
550 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  31.37 
 
 
550 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  31.37 
 
 
550 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  30 
 
 
550 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  33.13 
 
 
545 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  32.8 
 
 
545 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  31.81 
 
 
553 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  31.82 
 
 
547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>