More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1742 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  70.72 
 
 		 462 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  100 
 
 		 464 aa  949    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  69.85 
 
 		 462 aa  630  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  61.77 
 
 		 467 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  60.95 
 
 		 467 aa  568  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  63.42 
 
 		 462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  59.57 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  60.3 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  60.22 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  52.28 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  50.22 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  49.46 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.41 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  48.38 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  48.21 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  48.83 
 
 		 471 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  48.17 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.37 
 
 		 492 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  41.11 
 
 		 450 aa  335  9e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  39.29 
 
 		 478 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  38.03 
 
 		 452 aa  269  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  36.76 
 
 		 458 aa  259  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  36.16 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  36.83 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.26 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  31.77 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.33 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.6 
 
 		 453 aa  207  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  30.82 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  28.79 
 
 		 460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  30.39 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.65 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  30.04 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  30.93 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  29.23 
 
 		 475 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  30.24 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  29.85 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  29.61 
 
 		 465 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  30.12 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  30.43 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  29.88 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  29.88 
 
 		 466 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  29.13 
 
 		 465 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  28.42 
 
 		 854 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  28.32 
 
 		 868 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  32.15 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  29.13 
 
 		 458 aa  182  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  31.19 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  29.18 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  29.45 
 
 		 471 aa  180  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  29.45 
 
 		 471 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  30.94 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  28.79 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  28.51 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  29.37 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  27.65 
 
 		 863 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  30.29 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  29.93 
 
 		 467 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  32.69 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.89 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  30.09 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  28.79 
 
 		 488 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  28.61 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.78 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  29.65 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  28.15 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.36 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  28.81 
 
 		 782 aa  170  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  29.11 
 
 		 782 aa  170  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.29 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  27.52 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  30.61 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  29.2 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  28.27 
 
 		 461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  30.35 
 
 		 468 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  27.7 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  28.79 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  29.2 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  29.91 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.33 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  29.45 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  29.6 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  29.4 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  29.07 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  29.4 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  27.87 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  29.84 
 
 		 456 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0383  phosphoglucosamine mutase  29.19 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  29.5 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  27.77 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  29.22 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  29.03 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  29.31 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  27.79 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1597  phosphoglucosamine mutase  29.19 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.38 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  27.8 
 
 		 472 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  29.33 
 
 		 450 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  29.1 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>