More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0504 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  93.49 
 
 		 430 aa  838    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  94.65 
 
 		 430 aa  851    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 430 aa  884    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  45.41 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.92 
 
 		 433 aa  349  7e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.8 
 
 		 419 aa  342  7e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.82 
 
 		 418 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  41.12 
 
 		 419 aa  322  7e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.57 
 
 		 418 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.96 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.81 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  38.11 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  37.53 
 
 		 437 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  37.38 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  37.61 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  37.83 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.99 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  40.37 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  39.34 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.07 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  36.97 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  39.66 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  35.7 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  36.26 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  37.09 
 
 		 480 aa  246  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  33.63 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  35.06 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.03 
 
 		 456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.71 
 
 		 453 aa  223  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 		 455 aa  220  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 		 454 aa  219  5e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  33.18 
 
 		 458 aa  216  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  31.14 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  31.22 
 
 		 448 aa  212  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  33.01 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.53 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  30.39 
 
 		 449 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  30.35 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  30.63 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  31.33 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  30.42 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  32.65 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  34.11 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  34.11 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.03 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  33.56 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  31.57 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  31.03 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  31.17 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  31.89 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  31.54 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  28.19 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  32.36 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  31.36 
 
 		 447 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  33.02 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  32.1 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  32.17 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  32.1 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  31.91 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  29.66 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  30.24 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  31.18 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  31.46 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  33.8 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  31.46 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  31.95 
 
 		 459 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  31.71 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  33.8 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  33.41 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  34.09 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  32.44 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  31.33 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  31.52 
 
 		 454 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  30.85 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  30.55 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  32.07 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  29.84 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  28.93 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  32.95 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  32.59 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  30.31 
 
 		 460 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  31.45 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  29.61 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  31.14 
 
 		 454 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  32.42 
 
 		 449 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.56 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  32.58 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  30.8 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  31.28 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  33.86 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  34.3 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  32.37 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  33.56 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>