More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4113 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  73.36 
 
 
446 aa  663    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  76.4 
 
 
446 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  73.36 
 
 
446 aa  663    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  89.29 
 
 
448 aa  813    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  70.67 
 
 
451 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  89.86 
 
 
450 aa  816    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
450 aa  907    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  89.84 
 
 
450 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  89.96 
 
 
448 aa  819    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  74.07 
 
 
446 aa  665    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  89.41 
 
 
449 aa  814    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  72.16 
 
 
449 aa  668    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  77.08 
 
 
446 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  88.51 
 
 
450 aa  801    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  75.39 
 
 
466 aa  701    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  74.72 
 
 
447 aa  677    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  66.89 
 
 
450 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  67.65 
 
 
465 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 
450 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  66.96 
 
 
451 aa  621  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  66.52 
 
 
448 aa  618  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  64.89 
 
 
450 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  64.97 
 
 
451 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  65.19 
 
 
459 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  64.97 
 
 
451 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 
445 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 
445 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  66.21 
 
 
456 aa  580  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  61.57 
 
 
450 aa  565  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  63.82 
 
 
448 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  63.95 
 
 
444 aa  554  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  61.69 
 
 
452 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  60.27 
 
 
452 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  59.96 
 
 
447 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  59.69 
 
 
447 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  59.23 
 
 
449 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  59.02 
 
 
447 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  60.36 
 
 
447 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  58.35 
 
 
447 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  58.13 
 
 
447 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  59.91 
 
 
447 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  55.03 
 
 
483 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  53.74 
 
 
454 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  54.44 
 
 
454 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  53.3 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  51.44 
 
 
460 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  51.56 
 
 
451 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  53.46 
 
 
450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  53.7 
 
 
454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  52.81 
 
 
450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 
450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  51.79 
 
 
451 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  52.44 
 
 
452 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  51.33 
 
 
453 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  52.26 
 
 
449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 
450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  52.19 
 
 
458 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 
450 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 
445 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 
455 aa  435  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 
455 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 
450 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
446 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 
446 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 
450 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  51.56 
 
 
451 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
446 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
445 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  49.55 
 
 
447 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
446 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
448 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  48.89 
 
 
446 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 
450 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 
447 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  51.22 
 
 
450 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  48.89 
 
 
446 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  48.55 
 
 
447 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  50.55 
 
 
454 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  50.55 
 
 
454 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  49.67 
 
 
447 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
444 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
463 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 
448 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  48.89 
 
 
447 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 
450 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
445 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 
445 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  50.89 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  48.07 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  51.58 
 
 
445 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  51.58 
 
 
445 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  49.34 
 
 
452 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  48.77 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3613  phosphoglucosamine mutase  51.67 
 
 
445 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  51.67 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>