More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2228 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
418 aa  853    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  61.93 
 
 
418 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  61.71 
 
 
419 aa  523  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  61.77 
 
 
416 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  56.51 
 
 
419 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  41.57 
 
 
430 aa  328  8e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  42.04 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  41.09 
 
 
430 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.86 
 
 
433 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  42.69 
 
 
434 aa  289  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  40.48 
 
 
416 aa  288  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  39.6 
 
 
452 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  39.5 
 
 
446 aa  280  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.3 
 
 
447 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.64 
 
 
442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  37.95 
 
 
437 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  37.71 
 
 
437 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  38.85 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  39.82 
 
 
445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  38.11 
 
 
480 aa  242  9e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  36.69 
 
 
450 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.37 
 
 
437 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  40.42 
 
 
446 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  33.56 
 
 
460 aa  222  8e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  34.93 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.25 
 
 
456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  32.44 
 
 
458 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  33.92 
 
 
452 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.02 
 
 
453 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  36.28 
 
 
454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  34.43 
 
 
455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  34.37 
 
 
454 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  33.41 
 
 
454 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  34.29 
 
 
444 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  32.13 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  32.43 
 
 
458 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
447 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  31.45 
 
 
451 aa  177  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  30.16 
 
 
449 aa  176  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  33.04 
 
 
459 aa  173  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  30.99 
 
 
451 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  33.05 
 
 
460 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  32.09 
 
 
449 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  32.57 
 
 
445 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  31.83 
 
 
447 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.72 
 
 
454 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  30 
 
 
449 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  32 
 
 
449 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  32.67 
 
 
452 aa  170  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.7 
 
 
452 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  29.56 
 
 
447 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  33.8 
 
 
449 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  31.6 
 
 
447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  30.52 
 
 
448 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  31.03 
 
 
450 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  30.75 
 
 
449 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31 
 
 
453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  31.6 
 
 
447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
444 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  30.45 
 
 
448 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  31.91 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  33.64 
 
 
452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  30.45 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  30.11 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  30.07 
 
 
448 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  29.33 
 
 
478 aa  164  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  32.02 
 
 
469 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  34.64 
 
 
456 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  32.49 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  32.81 
 
 
496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  32.81 
 
 
496 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  32.96 
 
 
450 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  31.76 
 
 
452 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  31.72 
 
 
448 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  31.47 
 
 
450 aa  162  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  34.09 
 
 
447 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1095  phosphoglucosamine mutase  32.5 
 
 
489 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100565  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  30.34 
 
 
448 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  31.79 
 
 
459 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  31.7 
 
 
450 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  33.41 
 
 
446 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  35.86 
 
 
444 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  31.37 
 
 
450 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  35.41 
 
 
448 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  31.17 
 
 
451 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  31.9 
 
 
451 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  31.57 
 
 
453 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2740  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.02 
 
 
445 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  32 
 
 
450 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  31.89 
 
 
451 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1664  phosphoglucosamine mutase  30.36 
 
 
444 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.194728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  31.15 
 
 
450 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  31.39 
 
 
448 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1258  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.09 
 
 
418 aa  159  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>