More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1100 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 452 aa  904    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  68.6 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  66.07 
 
 		 448 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  63.39 
 
 		 452 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  62.81 
 
 		 448 aa  571  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  62.95 
 
 		 445 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  61.52 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  61.07 
 
 		 450 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  64.51 
 
 		 444 aa  551  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  61.86 
 
 		 447 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  61.94 
 
 		 449 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  61.49 
 
 		 448 aa  551  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  60.77 
 
 		 465 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  60.59 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  61.02 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  62.81 
 
 		 450 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  61.04 
 
 		 448 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  61.42 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  62.22 
 
 		 447 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  59.24 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  62.12 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  59.24 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  60.27 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  59.78 
 
 		 451 aa  538  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  60.77 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  62.5 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  59.87 
 
 		 459 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  61.57 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  61.78 
 
 		 447 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  61.11 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  61.78 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  60.42 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  60.42 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  57.91 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  60 
 
 		 449 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  60.65 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  62.76 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  56.7 
 
 		 451 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  56.67 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  60.13 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  55.28 
 
 		 450 aa  489  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  54.71 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  54.38 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  53.67 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  57.37 
 
 		 469 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  56.78 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  53.14 
 
 		 454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  56.78 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  54.63 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  53.14 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  52.69 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  52.69 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  54.57 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  52.9 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  56.69 
 
 		 458 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  52.78 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  51.91 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  53.69 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  52.74 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  50.55 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  51.49 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  51.26 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  48.2 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  51.55 
 
 		 451 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  52.9 
 
 		 453 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  47.22 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  48.86 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  47.22 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  50.58 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  48.56 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  50.35 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  51.76 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 		 452 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  51.76 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  51.66 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 		 445 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  51.83 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  48.62 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  47.44 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  49.45 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  51.83 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3987  phosphoglucosamine mutase  49.45 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  49.45 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  52.8 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  48.13 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  50.33 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  52.9 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  48.34 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>