More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1176 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  85.18 
 
 		 452 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  72.46 
 
 		 447 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  89.82 
 
 		 452 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  89.82 
 
 		 452 aa  814    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  73.83 
 
 		 447 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  89.82 
 
 		 452 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  84.33 
 
 		 452 aa  767    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  94.68 
 
 		 451 aa  854    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  89.82 
 
 		 452 aa  815    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  89.82 
 
 		 452 aa  814    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  89.82 
 
 		 452 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1270  phosphoglucosamine mutase  95.79 
 
 		 451 aa  840    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  93.13 
 
 		 451 aa  840    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  86.06 
 
 		 452 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  72.69 
 
 		 447 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  70.69 
 
 		 447 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0818  phosphoglucosamine mutase  95.79 
 
 		 451 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  72.91 
 
 		 447 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 451 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  89.82 
 
 		 467 aa  813    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  89.82 
 
 		 452 aa  814    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1299  phosphoglucosamine mutase  95.79 
 
 		 451 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  99.78 
 
 		 451 aa  897    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  69.8 
 
 		 443 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  67.34 
 
 		 450 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  68.46 
 
 		 444 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1270  phosphoglucosamine mutase  67.47 
 
 		 457 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190809  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  68.23 
 
 		 444 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0856  phosphoglucosamine mutase  66.82 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.304504  normal  0.368726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 		 447 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 		 444 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2815  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  65.92 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1011  phosphoglucosamine mutase  67.04 
 
 		 450 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.79008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2626  phosphoglucosamine mutase  66.37 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  66.52 
 
 		 450 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  65.1 
 
 		 460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  62.53 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  61.56 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  58.48 
 
 		 447 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  57.85 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  58.93 
 
 		 453 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  56.5 
 
 		 447 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  57.89 
 
 		 450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  58.55 
 
 		 450 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  58.11 
 
 		 450 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  58.8 
 
 		 451 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  57.59 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  56.76 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  56.76 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  58.77 
 
 		 450 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  58.24 
 
 		 446 aa  511  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  57.37 
 
 		 445 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  58.15 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  57.08 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  56.18 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  58 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  56.05 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  58.28 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  55.28 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  55.51 
 
 		 443 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  59.58 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  59.58 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  57.27 
 
 		 445 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  56.07 
 
 		 450 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  57.4 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  57.4 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  57.4 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  56.03 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  56.18 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  57.91 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  57.4 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  56.18 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  55.38 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  56.03 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0168  phosphoglucosamine mutase  57.53 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000649392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  55.93 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  57.4 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  56.47 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  56.47 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  56.47 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  55.8 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002605  phosphoglucosamine mutase  56.63 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000248269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  55.58 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  56.47 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  56.54 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  55.93 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  54.48 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>