More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3553 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  95.96 
 
 		 445 aa  844    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  95.96 
 
 		 445 aa  844    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03402  phosphoglucosamine mutase  74.21 
 
 		 446 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  87.87 
 
 		 445 aa  775    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  85.84 
 
 		 446 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  94.14 
 
 		 445 aa  858    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 445 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0168  phosphoglucosamine mutase  76.87 
 
 		 446 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000649392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 445 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  95.73 
 
 		 445 aa  843    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  95.96 
 
 		 445 aa  844    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  87.84 
 
 		 445 aa  776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  69.07 
 
 		 447 aa  636    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3987  phosphoglucosamine mutase  85.84 
 
 		 446 aa  753    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 445 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  87.39 
 
 		 445 aa  774    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  95.96 
 
 		 445 aa  844    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  87.61 
 
 		 445 aa  769    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0594  phosphoglucosamine mutase  74.94 
 
 		 445 aa  671    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  71.85 
 
 		 445 aa  666    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  85.84 
 
 		 446 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  86.04 
 
 		 445 aa  768    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  95.51 
 
 		 445 aa  841    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  95.96 
 
 		 445 aa  844    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 445 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  73.2 
 
 		 444 aa  653    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 445 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  95.96 
 
 		 445 aa  844    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  95.96 
 
 		 445 aa  844    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002605  phosphoglucosamine mutase  75.73 
 
 		 446 aa  673    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000248269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  68.17 
 
 		 447 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  67.79 
 
 		 445 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  69.14 
 
 		 445 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  67.19 
 
 		 443 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  67.27 
 
 		 445 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  67.19 
 
 		 445 aa  607  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  68.31 
 
 		 445 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  68.31 
 
 		 445 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  66.82 
 
 		 445 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  67.79 
 
 		 445 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  68.02 
 
 		 445 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  66.59 
 
 		 443 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  68.02 
 
 		 445 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  68.24 
 
 		 445 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  68.02 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  68.02 
 
 		 445 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  67.04 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  68.02 
 
 		 445 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  63.53 
 
 		 450 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  62.28 
 
 		 450 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  62.05 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  62.75 
 
 		 446 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  62.98 
 
 		 446 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  61.12 
 
 		 447 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  62.11 
 
 		 447 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  62.42 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  62.05 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  61.83 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  61.16 
 
 		 452 aa  564  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  62.3 
 
 		 446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 		 455 aa  559  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 		 455 aa  559  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42860  phosphoglucosamine mutase  62.08 
 
 		 445 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  61.17 
 
 		 445 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  62.7 
 
 		 451 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  61.71 
 
 		 447 aa  548  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0774  phosphoglucosamine mutase  60.72 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226413  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  63.98 
 
 		 453 aa  548  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4717  phosphoglucosamine mutase  62.98 
 
 		 446 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  61.28 
 
 		 451 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0813  phosphoglucosamine mutase  65.31 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  61.38 
 
 		 450 aa  541  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  61.54 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  61.88 
 
 		 450 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  59.55 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3613  phosphoglucosamine mutase  62.44 
 
 		 445 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  58.48 
 
 		 452 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  57.27 
 
 		 452 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  58.47 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  59.28 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  58.78 
 
 		 447 aa  511  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  57.72 
 
 		 447 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  58.24 
 
 		 443 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  57.72 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  58.48 
 
 		 453 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  58.92 
 
 		 443 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  59.18 
 
 		 446 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  59.05 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 467 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>