More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2718 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 446 aa  908    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  61.02 
 
 		 451 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  60.54 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  59.6 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  59.91 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  61.74 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  61.74 
 
 		 446 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  61.52 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  59.73 
 
 		 453 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  59.23 
 
 		 455 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  59.23 
 
 		 455 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  60.13 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  59.42 
 
 		 445 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  60.13 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  61.49 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0774  phosphoglucosamine mutase  60.8 
 
 		 445 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226413  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 		 453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  59.73 
 
 		 448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  58.8 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4717  phosphoglucosamine mutase  62.19 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  58.84 
 
 		 451 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3613  phosphoglucosamine mutase  61.92 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  57.05 
 
 		 447 aa  508  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42860  phosphoglucosamine mutase  60.58 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  59.95 
 
 		 445 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  59.19 
 
 		 446 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  59.55 
 
 		 445 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  59.33 
 
 		 445 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  59.19 
 
 		 446 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3987  phosphoglucosamine mutase  59.19 
 
 		 446 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  57.92 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  57.58 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  58.07 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  57.14 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  57.56 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  55.96 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  56.92 
 
 		 446 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  57.3 
 
 		 450 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  56.24 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  59.28 
 
 		 447 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  58.69 
 
 		 445 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  58.69 
 
 		 445 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  57.14 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  57.36 
 
 		 450 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  56.92 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  58.69 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  58.69 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  58.69 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  58.69 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  58.47 
 
 		 445 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  58.69 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  58.47 
 
 		 445 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  57.4 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  58.47 
 
 		 445 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  56.79 
 
 		 445 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  58.47 
 
 		 445 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  58.47 
 
 		 445 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  58.69 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  58.69 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  56.51 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  55.63 
 
 		 447 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  58.97 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  56.85 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  57.81 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  56.67 
 
 		 450 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  55.88 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  57.08 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  55.66 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  56.17 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  56.63 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  57.08 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  56.4 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  56.4 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  55.23 
 
 		 451 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  56.79 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  56.79 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  57.24 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  56.85 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  55.65 
 
 		 450 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  54.85 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  54.93 
 
 		 443 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  56.01 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  54.2 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  54.48 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  55.66 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1260  phosphoglucosamine mutase  54.55 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000461219  normal  0.0582076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0594  phosphoglucosamine mutase  56.63 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  54.95 
 
 		 447 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  54.48 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  55.09 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  56.43 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>